Cookie Hinweis

Wir verwenden Cookies, um Ihnen ein optimales Webseiten-Erlebnis zu bieten. Dazu zählen Cookies, die für den Betrieb der Seite notwendig sind, sowie solche, die lediglich zu anonymen Statistikzwecken, für Komforteinstellungen oder zur Anzeige personalisierter Inhalte genutzt werden. Sie können selbst entscheiden, welche Kategorien Sie zulassen möchten. Bitte beachten Sie, dass auf Basis Ihrer Einstellungen womöglich nicht mehr alle Funktionalitäten der Seite zur Verfügung stehen. Weitere Informationen finden Sie in unseren Datenschutzhinweisen .

Essentiell

Diese Cookies sind für die Funktionalität unserer Website erforderlich und können nicht deaktiviert werden.

Name Webedition CMS
Zweck Dieses Cookie wird vom CMS (Content Management System) Webedition für die unverwechselbare Identifizierung eines Anwenders gesetzt. Es bietet dem Anwender bessere Bedienerführung, z.B. Speicherung von Sucheinstellungen oder Formulardaten. Typischerweise wird dieses Cookie beim Schließen des Browsers gelöscht.
Name econda
Zweck Session-Cookie für die Webanalyse Software econda. Diese läuft im Modus „Anonymisiertes Messen“.
Statistik

Diese Cookies helfen uns zu verstehen, wie Besucher mit unserer Webseite interagieren, indem Informationen anonym gesammelt und analysiert werden. Je nach Tool werden ein oder mehrere Cookies des Anbieters gesetzt.

Name econda
Zweck Measure with Visitor Cookie emos_jcvid
Externe Medien

Inhalte von externen Medienplattformen werden standardmäßig blockiert. Wenn Cookies von externen Medien akzeptiert werden, bedarf der Zugriff auf diese Inhalte keiner manuellen Zustimmung mehr.

Name YouTube
Zweck Zeige YouTube Inhalte
Name Twitter
Zweck Twitter Feeds aktivieren

Nachwuchsgruppe Somatische Evolution und Früherkennung

Dr. Angela Goncalves

© dkfz.de

Wir untersuchen die Entstehung und Ausbreitung mutierter Klone in den Stadien vor der Entwicklung bösartiger Tumoren. Um diese frühen Stadien zu untersuchen, verbinden wir experimentelle Ansätze mit bioinformatischen Analysen und statistischer Modellierung - mit der langfristigen Aussicht, die Früherkennung von Krebs zu verbessern.
Das Modell der mutierten klonalen Evolution durch natürliche Auslese spielt eine entscheidende Rolle bei der Entwicklung von Krebs. Jedoch war es vor der Entwicklung von kostengünstigen Hochdurchsatz-Next Generation Sequencing (NGS) Methoden schwierig, diesen Prozess detailliert zu untersuchen. Durch NGS ist es nun möglich, Veränderungen sogar in sehr kleinen Zellanteilen aufzuspüren. Indem wir diese Veränderungen in Modelle überführen, können wir die Entstehung mutierter Allele in Geweben besser verstehen. Außerdem benutzen wir neuartige Methoden der Einzelzell-RNA-Sequenzierung, um somatische Mutationen in einzelnen Zellen zu identifizieren und deren Effekte auf die Expression von Genen zu bewerten – ein Ansatz, der bei der Interpretation der Effekte von Keimbahnveränderungen erkenntnisreich war. Ein wesentlicher Bestandteil unserer Arbeit ist daher die Interpretation dieser Daten und die Entwicklung neuer Methoden für die Analyse von NGS-Daten im Zusammenhang mit der Entstehung von Krebs.
Weiterhin arbeiten wir daran, die Beziehungen zwischen Genotyp und Phänotyp besser zu verstehen und vorherzusagen. Dazu entwickeln wir rechnergestützte Methoden für hochdimensionale Daten, etwa für Merkmalsauswahl und differentielles Testen.

Ausblick
Die Analyse longitudinal erworbenen nicht-krebsartigen Gewebes bietet ein wirkungsvolles Mittel, um die Evolution somatischer Mutationen zu untersuchen. Wir verwenden menschliches gynäkologisches Gewebe als Modellsystem, da dieses leicht über einen längeren Zeitraum von gesunden Individuen erworben werden kann und medizinisch von großer Bedeutung ist. In interdisziplinären Forschungsprojekten mit Krebsforschern und Klinikärzten möchten wir künftig DNA-Tiefensequenzierungsdaten und Einzelzell-RNA-Sequenzierungsdaten von Gewebeproben analysieren, um ein quantitatives Verständnis somatischer Evolution zu erlangen.

Kontakt

Dr. Angela Goncalves
Somatische Evolution und Früherkennung (B210)
Deutsches Krebsforschungszentrum
Im Neuenheimer Feld 580
69120 Heidelberg

Ausgewählte Publikationen

  • Winkler I., Tolkachov A., Lammers F., Lacour P., Schneider N., Koch M.L., Panten J., Grünschläger F., Daugelaite K., Poth T., Haas S., Odom D.T., Goncalves A. (2022). The function and decline of the female reproductive tract at single-cell resolution. bioRxiv.
  • Schefzik R., Flesch J., Goncalves A. (2020). Fast identification of differential distributions in single-cell RNA-sequencing data with waddR. Bioinformatics, btab226.
  • Vento-Tormo R., Efremova M., Turco M.Y., Botting R.A., Meyer K.B., Park J., Stephenson E., Payne R.P., Goncalves A., Zou A., Henriksson J., Wood L., Lisgo S., Filby A., Wright G.J., Stubbington M.J.T., Haniffa M., Moffett A., Teichmann S.A. (2018). Reconstructing the human first trimester fetal-maternal interface using single cell transcriptomics. Nature. 546, 370-375.
  • 2023-03-09 13:14:12
nach oben
powered by webEdition CMS