Epigenomik

  • Funktionelle und Strukturelle Genomforschung
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Prof. Dr. Christoph Plass

Abteilungsleiter

Unsere Abteilung erforscht den Beitrag epigenetischer Veränderungen zu Krebs, von der Frage, wie epigenetische Veränderungen das Tumorwachstum fördern, bis hin zur Frage, wie sie Krebstherapien beeinflussen. Nicht-genetische Mechanismen der Therapieresistenz sind auf molekularer Ebene nur unzureichend verstanden und stellen einen ungedeckten klinischen Bedarf dar, den wir in verschiedenen Projekten angehen wollen.

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Unsere Forschung

Die Abteilung für Krebsepigenomik konzentriert sich auf die Integration von epigenomischen, genetischen und transkriptomischen Daten, um epigenomische Veränderungen zu entschlüsseln, die zu bösartigen Erkrankungen des Menschen beitragen, wobei der Schwerpunkt auf akuter myeloischer Leukämie, chronischer lymphatischer Leukämie, Brust-, Lungen- und Prostatakrebs liegt. Eine veränderte epigenetische Regulierung der Genexpression durch Veränderungen der DNA-Methylierungsmuster, der Histonmodifikationen und der Positionierung der Nukleosomen wurde als tumorigener Mechanismus bei fast allen bösartigen Erkrankungen des Menschen identifiziert. Die epigenetische Genregulation durch Modulation der Enhancer-Aktivität wird heute als neues Konzept in der Krebsepigenomik anerkannt. Epigenetische Modifikationen verändern nicht die Gensequenz und bieten die vielversprechende Möglichkeit, sie durch Hemmstoffe epigenetischer Enzyme rückgängig zu machen. Unsere Arbeit stützt sich auf den Einsatz modernster Technologien, einschließlich genomweiter epigenomischer Profilerstellung gereinigter Zelltypen unter Verwendung von Low-Input-Protokollen, Einzelzelltechnologien, Long-Read-Sequenzierung und hochentwickelter computergestützter Analysen von Omics-Daten.

Die weiterführenden Seiten sind derzeit nur auf Englisch verfügbar.

Teams (Englisch)

Krebs-Epigenomik (Christoph Plass)
Computerbasierte und Einzelzell-Epigenomik (Michael Scherer)
Epigenomik hormonsensitiver Tumore (Clarissa Gerhäuser)
Lungenkrebs-Epigenomik (Maria Llamazares-Prada)

Team leader

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    Prof. Dr. Christoph Plass

    Abteilungsleiter

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  • Ein Porträt einer lächelnden Frau mit Brille, kurzen blonden Haaren und einer hellen Jacke. Sie trägt ein farbiges Halstuch und steht vor einer grünen Hintergrundkulisse.

    Dr. Clarissa Gerhäuser

    Team Leader Epigenomics of hormone-driven Cancer

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  • Eine Frau mit langen, lockigen Haaren und einem freundlichen Lächeln trägt ein rotes Oberteil. Der Hintergrund ist neutral, wodurch der Fokus auf ihrem Gesicht liegt.

    Dr. Maria Llamazares Prada

    Team Leader Lung Cancer Epigenomics

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  • Ein junger Mann mit kurzen, braunen Haaren lächelt in die Kamera. Er trägt ein graues T-Shirt mit einer rot gestreiften Brusttasche. Im Hintergrund ist ein neutraler, heller Farbton zu sehen.

    Dr. Michael Scherer

    Team Leader Computational and Single-Cell Epigenomics

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Gesamtes Team

B370 team

Methoden

Methoden (Englisch)

Ausgewählte Publikationen

2025 - The Journal of Clinical Investigation

Guokun Zhang, Vindi Jurinovic, Stephan Bartels, Matthias Christgen, Henriette Christgen, Leonie Donata Kandt, Lidiya Mishieva, Hua Ni, Mieke Raap, Janin Klein, Anna-Lena Katzke, Winfried Hofmann, Doris Steinemann, Ronald E. Kates, Oleg Gluz, Monika Graeser, Sherko Kuemmel, Ulrike Nitz, Christoph Plass, Ulrich Lehmann, Christine zu Eulenburg, Ulrich Mansmann, Clarissa Gerhauser, Nadia Harbeck, Hans H. Kreipe

2025 - Blood Cancer Discovery 6 (4): 343–363

Etienne Sollier, Anna Riedel, Umut H. Toprak, Justyna A. Wierzbinska, Dieter Weichenhan, Jan Philipp Schmid, Mariam Hakobyan, Aurore Touzart, Ekaterina Jahn, Binje Vick, Fiona Brown-Burke, Katherine Kelly, Simge Kelekçi, Anastasija Pejkovska, Ashish Goyal, Marion Bähr, Kersten Breuer, Mei-Ju May Chen, Maria Llamazares-Prada, Mark Hartmann, Maximilian Schönung, Nadia Correia, Andreas Trumpp, Yomn Abdullah, Ursula Klingmüller, Sadaf S. Mughal, Benedikt Brors, Frank Westermann, Elias Ulrich, Robert J. Autry, Matthias Schlesner, Sebastian Vosberg, Tobias Herold, Philipp A. Greif, Dietmar Pfeifer, Michael Lübbert, Thomas Fischer, Florian H. Heidel, Claudia Gebhard, Wencke Walter, Torsten Haferlach, Ann-Kathrin Eisfeld, Krzysztof Mrózek, Deedra Nicolet, Lars Bullinger, Leonie Smeenk, Claudia Erpelinck-Verschueren, Roger Mulet-Lazaro, Ruud Delwel, Aurélie Ernst, Michael Scherer, Pavlo Lutsik, Irmela Jeremias, Konstanze Döhner, Hartmut Döhner, Daniel B. Lipka, Christoph Plass

2025 - Nature 643, 478–487

Michael Scherer, Indranil Singh, Martina Maria Braun, Chelsea Szu-Tu, Pedro Sanchez Sanchez, Dominik Lindenhofer, Niels Asger Jakobsen, Verena Körber, Michael Kardorff, Lena Nitsch, Pauline Kautz, Julia Rühle, Agostina Bianchi, Luca Cozzuto, Robert Frömel, Sergi Beneyto-Calabuig, Caleb Lareau, Ansuman T. Satpathy, Renée Beekman, Lars M. Steinmetz, Simon Raffel, Leif S. Ludwig, Paresh Vyas, Alejo Rodriguez-Fraticelli & Lars Velten

2024 - Genome Biology 25: 305

Katherine Kelly, Michael Scherer, Martina Maria Braun, Pavlo Lutsik & Christoph Plass

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