Wissenschaftliche Core Facilities und Services
Wissenschaftler:innen am DKFZ und Partnerstandorten steht ein breites Portfolio an Forschungsinfrastrukturen zur Verfügung: klassische Core Facilities, forschungsgetriebene Service-Plattformen sowie Daten-, Literatur- und IT-Services. Nutzer:innen erhalten Zugang zu modernsten Technologien und Expertenwissen. Methodenentwicklung, Forschungsdaten-Management und digitale state-of-the-art Ressourcen ergänzen das Angebot.
Neuigkeiten aus den Core Facilities
Am 24. Februar 2025 findet am DKFZ ein Hands-on Workshop zur Software HORIZON™ von Lunaphore Technologies (eine Bio-Techne Marke) statt. HORIZON ist eine benutzerfreundliche Software-Suite zur Analyse antikörperbasierter räumlicher Proteomikdaten, die mit dem COMET™ System erzeugt wurden, und ermöglicht es, in wenigen Klicks aussagekräftige multiomische Einblicke zu gewinnen.
Der Workshop richtet sich an Anwender:innen, die ihre räumlichen Proteomikdaten effizient auswerten möchten, und bietet praktische Übungen mit realen Beispieldaten.
Datum: 24. Februar 2025, 9:00–14:00 Uhr
Ort: ATV-Gebäude, Seminarraum A0.106, Erdgeschoss
Organisation: Single-cell Open Lab, DKFZ
Workshop-Leitung: Jan-Philipp Mallm, Ph.D.
Die Teilnahme erfordert eine vorherige Anmeldung. Bitte geben Sie bei der Registrierung an, ob Sie einen eigenen Windows-Laptop mitbringen können.
Registrierung:
https://lunaphore.com/our-events/dkfz-heidelberg-horizon-workshop/
Die NGS Core Facility am DKFZ bietet im März 2026 zwei praxisorientierte Schulungen zur Nutzung der Galaxy Bioinformatik-Plattform an. Die Kurse richten sich an DKFZ-interne Forschende und unterstützen eine reproduzierbare und benutzerfreundliche Analyse von Next-Generation-Sequencing-Daten.
Practical Introduction to the Galaxy Bioinformatics Platform
18. März 2026 | 09:00–17:00 Uhr
DKFZ-Hauptgebäude, 8. Stock, Raum H824
Dieser eintägige Einführungskurs vermittelt die grundlegende Nutzung der Galaxy-Plattform. Behandelt werden unter anderem der Import und das Management großer Datensätze sowie erste Analyse-Workflows anhand von NGS-Daten. Der Kurs eignet sich besonders für Einsteigerinnen und Einsteiger.
Practical RNA-Seq Analysis in Galaxy
19. März 2026 | 09:00–17:00 Uhr
DKFZ-Hauptgebäude, 8. Stock, Raum H824
Dieser Kurs fokussiert sich auf die RNA-Seq-Datenanalyse in Galaxy mit einem besonderen Schwerpunkt auf der Differenziellen Genexpressionsanalyse (DGE) mit DESeq2. Die Teilnehmenden lernen alle wesentlichen Schritte kennen – von Quality Control und Read-Mapping bis zur Visualisierung und Interpretation der Ergebnisse.
Grundkenntnisse der Galaxy-Plattform werden dringend empfohlen.
Anmeldung: Die Kurse sind DKFZ-intern und können über das interne Trainingsportal gebucht werden. Es sind aktuell noch einige Plätze verfügbar.
Wussten Sie schon? Die Core Facilities des DKFZ sind jetzt auch auf LinkedIn vertreten! Dort teilen wir spannende Einblicke in unsere Technologien, aktuelle Entwicklungen und Neuigkeiten aus den Core Facilities.
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Die DKFZ Core Facilities und Services sind nachfolgend nach ihren Fachgebieten aufgeführt.
Genom, Epigenom & Transkriptom
Die NGS Core Facility bietet DNA- und RNA-Sequenzierungen auf der Basis der Illumina MiSeq-, NextSeq- und NovaSeq-Technologien sowie der Oxford Nanopore-Technologien an.
Mehr Informationen über die Next Generation Sequencing Core Facility
Die Microarray Core Facility bietet modernste Microarray-Technologien für die Analyse von Expressionsprofilen, Methylierung und Genotypisierung/Copy-Number-Variation (CNV). Die Hochdurchsatz-Proteinanalyse mit der innovativen Olink®-Technologie, die Erstellung von Kinase-Aktivitätsprofilen sowie der assistierte Zugang zu ddPCR- und qPCR-Instrumenten und Ingenuity gehören ebenfalls zum Serviceportfolio.
Das Single-cell Open Lab bietet eine Infrastruktur für die Aufbereitung von Zellen, die Vorbereitung von Bibliotheken für die Einzelzellsequenzierung sowie für Spatial Omics an.
Die Präklinische und Translationale Pathologie bietet eine Infrastruktur für Services entlang des gesamten histologischen Workflows – von Probenpräparation über diverse Färbemethoden bis zur Digitalisierung der Schnitte..
Mehr Informationen über die Präklinische und Translationale Pathologie
Proteom
Die Proteomics Core Facility bietet Massenspektrometrie-basierte Analysen des Proteoms an. Modernste Technologien in Kombination mit spezialisierten Arbeitsabläufen ermöglichen eine äußerst sensitive und tiefgreifende Proteomanalyse.
Das Single-cell Open Lab bietet eine Infrastruktur für die Aufbereitung von Zellen, die Vorbereitung von Bibliotheken für die Einzelzellsequenzierung sowie für Spatial Omics an.
Die Microarray Core Facility bietet modernste Microarray-Technologien für die Analyse von Expressionsprofilen, Methylierung und Genotypisierung/Copy-Number-Variation (CNV). Die Hochdurchsatz-Proteinanalyse mit der innovativen Olink®-Technologie, die Erstellung von Kinase-Aktivitätsprofilen sowie der assistierte Zugang zu ddPCR- und qPCR-Instrumenten und Ingenuity gehören ebenfalls zum Serviceportfolio.
Die AntikörperCore Facility bietet die Herstellung von monoklonalen Antikörpern (Maus/Ratte) durch die Hybridomtechnologie und die Herstellung von polyklonalen Antikörpern (Meerschweinchen) an. Darüber hinaus bietet die Facility die Sequenzierung von Antikörpern, das Engineering und die rekombinante Expression an.
Die Präklinische und Translationale Pathologie bietet eine Infrastruktur für Services entlang des gesamten histologischen Workflows – von Probenpräparation über diverse Färbemethoden bis zur Digitalisierung der Schnitte..
Mehr Informationen über die Präklinische und Translationale Pathologie
Metabolom
Die Metabolomics Core Technology Platform (MCTP) ist eine zentrale Einrichtung der Universität Heidelberg und hat eine offizielle Kooperation mit dem DKFZ . Sie ist im Centre for Organismal Studies angesiedelt. Wir bieten ein breites Spektrum an qualitativen und quantitativen Metabolomics-Dienstleistungen für verschiedene Probenmatrices für alle DKFZ-Gruppen an.
Mehr Informationen über die Metabolomics Core Technology Platform
Zelluläre und Präklinische Bildgebung
Die Elektronenmikroskopie Core Facility führt Experimente in Vollservice für ultrastrukturelle Studien mittels TEM und SEM durch.
Mehr Informationen über die Elektronenmikroskopie Core Facility
Die Lichtmikroskopie Core Facility bietet an mehreren Standorten auf dem Campus eine Reihe von Dienstleistungen rund um die Bildgebung an. Wir bieten Beratung, praktische Schulungen, technische Unterstützung und einen offenen Zugang (24/7) zu hochmodernen Instrumenten und einer breiten Palette von Anwendungen.
Die Kleintierbildgebung Core Facility unterstützt die Nutzer bei der Anwendung zahlreicher radiologischer Methoden wie Ultraschall, optische Bildgebung, µPET, µCT, µSPECT und MRT-Messungen zur Erfassung und Quantifizierung morphologischer und funktioneller Daten in vivo.
Mehr Informationen über die Kleintierbildgebung Core Facility
Neben Bildgebung und Bestrahlungsplanung/Bestrahlung für präklinische Studien, berät und unterstützt die Service Unit Nutzer bei der Experimentalplanung für Tierversuchsstudien.
Mehr Informationen zur Service Unit für Radiopharmazeutika und Präklinische Studien
Zytometrie und Screening
Die Chemische Biologie Core Facility (CBCF) bietet die Infrastruktur und Expertise für Hochdurchsatz-Screenings von Molekül-Bibliotheken (wirkstoff-ähnliche Substanzen) gegen biologische Zielstrukturen. Somit ermöglicht die CBCF Forschungsgruppen, Wirkstoffe zu identifizieren und zu entwickeln mit denen sie in Ihrer Forschung wichtige Fragestellungen beleuchten können oder die auch schon Anfangspunkte für eine Medikamentenentwicklung sein können.
Mehr Informationen über die Chemische Biologie Core Facility
Die Durchflusszytometrie Core Facility berät und unterstützt Wissenschaftler:innen bei der Planung, Durchführung und Auswertung von durchflusszytometrischen Analysen und Zellsortierungen. Hierfür stehen modernste Geräte (Analysegeräte und Zellsorter) sowie verschiedene Software zur Verfügung.
Mehr Informationen über die Durchflusszytometrie Core Facility
Die Immun Monitoring Einheit begleitet onkologische Studien (IITs oder Industrie-gesponserte Studien) aller Phasen mit Hilfe verschiedener immunologischer State-of-the-art Analysetechniken.
Gewebe-basierte Analysen
Die Immun Monitoring Einheit begleitet onkologische Studien (IITs oder Industrie-gesponserte Studien) aller Phasen mit Hilfe verschiedener immunologischer State-of-the-art Analysetechniken.
Die Lichtmikroskopie Core Facility bietet an mehreren Standorten auf dem Campus eine Reihe von Dienstleistungen rund um die Bildgebung an. Wir bieten Beratung, praktische Schulungen, technische Unterstützung und einen offenen Zugang (24/7) zu hochmodernen Instrumenten und einer breiten Palette von Anwendungen.
Das Single-cell Open Lab bietet eine Infrastruktur für die Aufbereitung von Zellen, die Vorbereitung von Bibliotheken für die Einzelzellsequenzierung sowie für Spatial Omics an.
Die Präklinische und Translationale Pathologie bietet eine Infrastruktur für Services entlang des gesamten histologischen Workflows – von Probenpräparation über diverse Färbemethoden bis zur Digitalisierung der Schnitte..
Mehr Informationen über die Präklinische und Translationale Pathologie
Reagenzien und Tools für die Krebsforschung
Die AntikörperCore Facility bietet die Herstellung von monoklonalen Antikörpern (Maus/Ratte) durch die Hybridomtechnologie und die Herstellung von polyklonalen Antikörpern (Meerschweinchen) an. Darüber hinaus bietet die Facility die Sequenzierung von Antikörpern, das Engineering und die rekombinante Expression an.
Der Cellular Tools Core Facility bietet standardisierte Vektor- und Klonressourcen sowie modulare Dienstleistungen für zellbasierte Gain- und Loss-of-Function-Technologien.
Das Dieter Morszeck Biorepository ist ein vollautomatisches Kühllager, in dem wertvolle flüssige Bioproben gelagert werden.
Neben Bildgebung und Bestrahlungsplanung/Bestrahlung für präklinische Studien, berät und unterstützt die Service Unit Nutzer bei der Experimentalplanung für Tierversuchsstudien.
Mehr Informationen zur Service Unit für Radiopharmazeutika und Präklinische Studien
Tierexperimenteller Service
Das Zentrum für Präklinische Forschung (ZPF) berät und unterstützt Forscher bei der Planung und Durchführung ihrer Tierversuche.
Es besteht aus den vier Unterabteilungen Zentrales Tierlabor, Tumormodelle, Mikrobiologische Diagnostik und Transgen-Service.
Mehr Informationen über das Zentrum für Präklinische Forschung
Forschungsdaten Management
Die Omics IT und Daten Management Core Facility (ODCF) bietet den Gruppen am DKFZ und ihren Kooperationspartnern Hochdurchsatz-Computing, Datenmanagement und grundlegende Bioinformatikdienstleistungen an.
Mehr Informationen über die Omics IT und Daten Management Core Facility
Bibliothek und Informationstechnologie
Die Information Technology Core Facility (ITCF) ist verantwortlich für die optimale Nutzung der IT am DKFZ. Sie ist für die Unterstützung der Mitarbeiter aller Abteilungen bei der Auswahl von IT-Werkzeugen für ihre speziellen Bedürfnisse sowie für die Bereitstellung von zentralen IT-Services und Support verantwortlich.
Mehr Informationen über die Informationstechnologie Core Facility
Die Bibliothek stellt unter anderem wissenschaftliche Literatur und Informationen bereit, die von den Wissenschaftlern des Deutschen Krebsforschungszentrums benötigt werden.
Abteilung Enabling Technology
Die Abteilung Enabling Technology wird von der Chief Enabling Technology Officer Prof. Elisa May geleitet. Sie ist für die folgenden Core Facilities verantwortlich: Antikörper, Cellular Tools, Chemische Biologie (mit dem EMBL), Dieter Morszeck Biorepository, Elektronenmikroskopie, Durchflusszytometrie, Lichtmikroskopie, Microarray, Next Generation Sequencing, Proteomics, Single-cell Open Lab, kleintierbildgebung und die Spülküche. Die Abteilung ist auch an zwei Projekten zum Biomage-Datenmanagement beteiligt: dem DFG-Projekt „Informationsinfrastruktur für BioImage-Datenmanagement - I3D:bio“ und dem Konsortium „NFDI4BioImage“ in der Nationalen Forschungsdateninfrastruktur NFDI, in dem Prof. May als Co-Sprecher fungiert.
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Dr. Christian Schmidt
Wissenschaftlicher Projektmanager für Forschungsdaten Management
+49 6221 42 2657 -