DKFZ-Juniorgruppe Genominstabilität in Tumoren

PD Dr. Aurélie Ernst

Chromothripsis ist ein neues Phänomen der Genominstabilität, bei dem vermutlich ein einziges katastrophales Ereignis in der Zelle umfangreiche genomische Umlagerungen eines oder weniger Chromosomen bewirkt. Vor der Ära des next generation sequencing war dieses Phänomen unbekannt. Chromothripsis könnte einen erheblichen Anteil der Krebsfälle beim Menschen auslösen – da immer mehr Krebsgenome sequenziert werden, kommen immer mehr Tumorentitäten mit einer Prävalenz für Chromothripsis von über 30% zutage. Darüber hinaus ist die Chromothripsis mit einer schlechten Prognose für die Patienten verbunden.

Unser Ziel ist es, die mechanistischen Grundlagen dieses Prozesses, den Kontext, in dem er auftritt, und die Auswirkungen auf Krebspatienten zu entschlüsseln.

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PD Dr. Aurélie Ernst

Genominstabilität in Tumoren (B420)

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Simovic M, Bolkestein M, Moustafa M, Wong JKL, Körber V, Benedetto S, Khalid U, Schreiber HS, Jugold M, Korshunov A, Hübschmann D, Mack N, Brons S, Wei PC, Breckwoldt MO, Heiland S, Bendszus M, Jürgen D, Höfer T, Zapatka M, Kool M, Pfister SM, Abdollahi A, Ernst A. Carbon ion radiotherapy eradicates medulloblastomas with chromothripsis in an orthotopic Li-Fraumeni patient-derived mouse model. Neuro Oncol. 2021 May 28:noab127. doi: 10.1093/neuonc/noab127. PMID: 34049392
Bolkestein M, Wong JKL, Thewes V, Körber V, Hlevnjak M, Elgaafary S, Schulze M, Kommoss FKF, Sinn HP, Anzeneder T, Hirsch S, Devens F, Schröter P, Höfer T, Schneeweiss A, Lichter P, Zapatka M, Ernst A. Chromothripsis in Human Breast Cancer. Cancer Res. 2020 Nov 15;80(22):4918-4931. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-20-1920. PMID: 32973084
Voronina N, Wong JKL, Hübschmann D, Hlevnjak M, Uhrig S, Heilig CE, Horak P, Kreutzfeldt S, Mock A, Stenzinger A, Hutter B, Fröhlich M, Brors B, Jahn A, Klink B, Gieldon L, Sieverling L, Feuerbach L, Chudasama P, Beck K, Kroiss M, Heining C, Möhrmann L, Fischer A, Schröck E, Glimm H, Zapatka M, Lichter P, Fröhling S, Ernst A. The landscape of chromothripsis across adult cancer types. Nat Commun. 2020 May 8;11(1):2320. doi: 10.1038/s41467-020-16134-7.
Ratnaparkhe M, Wong JKL, Wei PC, Hlevnjak M, Kolb T, Simovic M, Haag D, Paul Y, Devens F, Northcott P, Jones DTW, Kool M, Jauch A, Pastorczak A, Mlynarski W, Korshunov A, Kumar R, Downing SM, Pfister SM, Zapatka M, McKinnon PJ, Alt FW, Lichter P, Ernst A. Defective DNA damage repair leads to frequent catastrophic genomic events in murine and human tumors. Nat Commun. 2018 Nov 12;9(1):4760. doi: 10.1038/s41467-018-06925-4. PMID: 30420702

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