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Publications of Molecular Genetics

2018

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The case for DNA methylation based molecular profiling to improve diagnostic accuracy for central nervous system embryonal tumors (not otherwise specified) in adults.
Journal of clinical neuroscience 47, 163 - 167 () [10.1016/j.jocn.2017.09.013]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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NFATC1 activation by DNA hypomethylation in chronic lymphocytic leukemia correlates with clinical staging and can be inhibited by ibrutinib.
International journal of cancer 142(2), 322 - 333 () [10.1002/ijc.31057]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Analysis of Epstein-Barr Virus Genomes and Expression Profiles in Gastric Adenocarcinoma.
Journal of virology 92(2), e01239-17 - () [10.1128/JVI.01239-17]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Chromothripsis is linked to TP53 alteration, cell cycle impairment, and dismal outcome in acute myeloid leukemia with complex karyotype.
Haematologica 103(1), e17 - e20 () [10.3324/haematol.2017.180497]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Integrative genomic and transcriptomic analysis of leiomyosarcoma.
Nature Communications 9(1), 144 () [10.1038/s41467-017-02602-0]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ; et al
Drug-perturbation-based stratification of blood cancer.
The journal of clinical investigation 128(1), 427 - 445 () [10.1172/JCI93801]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ; et al
Therapeutic targeting of ependymoma as informed by oncogenic enhancer profiling.
Nature <London> 553(7686), 101 - 105 () [10.1038/nature25169]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Evidence for a pre-malignant cell line in a skin biopsy from a patient with Nijmegen breakage syndrome.
Molecular cytogenetics 11(1), 17 () [10.1186/s13039-018-0364-6]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;
Correction to: Dosimetry in clinical radionuclide therapy: the devil is in the detail
European journal of nuclear medicine and molecular imaging 45(4), 676 - 676 () [10.1007/s00259-017-3921-z]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ; et al
DNA methylation-based classification of central nervous system tumours.
Nature <London> 555(7697), 469 - 474 () [10.1038/nature26000]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Tumor necrosis factor receptor signaling is a driver of chronic lymphocytic leukemia that can be therapeutically targeted by the flavonoid wogonin.
Haematologica 103(4), 688 - 697 () [10.3324/haematol.2017.177808]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ; et al
The landscape of genomic alterations across childhood cancers.
Nature <London> 555(7696), 321 - 327 () [10.1038/nature25480]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
A Novel Method for Rapid Molecular Subgrouping of Medulloblastoma.
Clinical cancer research 24(6), 1355 - 1363 () [10.1158/1078-0432.CCR-17-2243]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;
Correction for Borozan et al., 'Analysis of Epstein-Barr Virus Genomes and Expression Profiles in Gastric Adenocarcinoma'.
Journal of virology 92(10), e00330-18 - () [10.1128/JVI.00330-18]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;
An image-based small-molecule screen identifies vimentin as a pharmacologically relevant target of simvastatin in cancer cells.
The FASEB journal 32(5), 2841 - 2854 () [10.1096/fj.201700663R]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Assembly Kinetics of Vimentin Tetramers to Unit-Length Filaments: A Stopped-Flow Study.
Biophysical journal 114(10), 2408 - 2418 () [10.1016/j.bpj.2018.04.032]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Risk-adapted therapy for young children with medulloblastoma (SJYC07): therapeutic and molecular outcomes from a multicentre, phase 2 trial.
The lancet <London> / Oncology 19(6), 768 - 784 () [10.1016/S1470-2045(18)30204-3]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ; et al
Spectrum and prevalence of genetic predisposition in medulloblastoma: a retrospective genetic study and prospective validation in a clinical trial cohort.
The lancet <London> / Oncology 19(6), 785 - 798 () [10.1016/S1470-2045(18)30242-0]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;
From Structure to Phenotype: Impact of Collagen Alterations on Human Health.
International journal of molecular sciences 19(5), 1407 () [10.3390/ijms19051407]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Molecular characterization of medulloblastomas with extensive nodularity (MBEN).
Acta neuropathologica 136(2), 303 - 313 () [10.1007/s00401-018-1840-0]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Methylation profiling of paediatric pilocytic astrocytoma reveals variants specifically associated with tumour location and predictive of recurrence.
Molecular oncology 12(8), 1219 - 1232 () [10.1002/1878-0261.12062]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Recurrent homozygous deletion of DROSHA and microduplication of PDE4DIP in pineoblastoma.
Nature Communications 9(1), 2868 () [10.1038/s41467-018-05029-3]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
A PRDX1-p38? heterodimer amplifies MET-driven invasion of IDH-wildtype and IDH-mutant gliomas.
International journal of cancer 143(5), 1176 - 1187 () [10.1002/ijc.31404]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;
Autoantigen-Harboring Apoptotic Cells Hijack the Coinhibitory Pathway of T Cell Activation.
Scientific reports 8(1), 10533 () [10.1038/s41598-018-28901-0]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Cited4 is a sex-biased mediator of the antidiabetic glitazone response in adipocyte progenitors.
EMBO molecular medicine 10(8), e8613 - () [10.15252/emmm.201708613]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;
CRISPR-mediated Loss of Function Analysis in Cerebellar Granule Cells Using In Utero Electroporation-based Gene Transfer.
Journal of visualized experiments 9(136), 57311 () [10.3791/57311]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Altered nuclear envelope structure and proteasome function of micronuclei.
Experimental cell research 371(2), 353 - 363 () [10.1016/j.yexcr.2018.08.029]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Glassy dynamics in composite biopolymer networks.
Soft matter 14(39), 7970 - 7978 () [10.1039/C8SM01061G]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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A biobank of patient-derived pediatric brain tumor models.
Nature medicine 24(11), 1752 - 1761 () [10.1038/s41591-018-0207-3]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Epithelioid glioblastomas stratify into established diagnostic subsets upon integrated molecular analysis.
Brain pathology 28(5), 656 - 662 () [10.1111/bpa.12566]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Checkpoint inhibition in the bone marrow
Nature biomedical engineering 2(11), 793 - 794 () [10.1038/s41551-018-0319-6]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Defective DNA damage repair leads to frequent catastrophic genomic events in murine and human tumors.
Nature Communications 9(1), 4760 () [10.1038/s41467-018-06925-4]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Cortactin expression: Association with disease progression and survival in oral squamous cell carcinoma.
Head & neck 40(12), 2685-2694 () [10.1002/hed.25515]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Validating Comprehensive Next-Generation Sequencing Results for Precision Oncology: The NCT/DKTK Molecularly Aided Stratification for Tumor Eradication Research Experience
JCO precision oncology 2, 1 - 13 () [10.1200/PO.18.00171]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Vimentin on the move: new developments in cell migration.
F1000Research 7, 1796 () [10.12688/f1000research.15967.1]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
CD84 regulates PD-1/PD-L1 expression and function in chronic lymphocytic leukemia.
The journal of clinical investigation 128(12), 5465 - 5478 () [10.1172/JCI96610]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;
A novel cloning strategy for one-step assembly of multiplex CRISPR vectors.
Scientific reports 8(1), 17499 () [10.1038/s41598-018-35727-3]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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