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Publications of Molecular Genetics

2022

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Clonal evolution in chronic lymphocytic leukemia is scant in relapsed but accelerated in refractory cases after chemo(immune)therapy.
Haematologica 107(3), 604-614 () [10.3324/haematol.2020.265777]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
A novel patient stratification strategy to enhance the therapeutic efficacy of dasatinib in glioblastoma.
Neuro-Oncology 24(1), 39-51 () [10.1093/neuonc/noab158]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Longitudinal analyses of CLL in mice identify leukemia-related clonal changes including a Myc gain predicting poor outcome in patients.
Leukemia 36, 464?475 () [10.1038/s41375-021-01381-4]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Evaluation of vecabrutinib as a model for non-covalent BTK/ITK inhibition for treatment of chronic lymphocytic leukemia.
Blood 139(6), 859-875 () [10.1182/blood.2021011516]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Association of mutation signature effectuating processes with mutation hotspots in driver genes and non-coding regions.
Nature Communications 13(1), 178 () [10.1038/s41467-021-27792-6]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;
Editorial: New Insights Into the Complexity of Tumor Immunology in B-Cell Malignancies: Prognostic and Predictive Biomarkers and Therapy.
Frontiers in oncology 11, 841763 () [10.3389/fonc.2021.841763]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;
Editorial: New Insights into the Complexity of Tumor Immunology in B-cell Malignancies: Tumor Immunology and Immunotherapy.
Frontiers in oncology 12, 853620 () [10.3389/fonc.2022.853620]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;
Compositional complementarity between genomic RNA and coat proteins in positive-sense single-stranded RNA viruses.
Nucleic acids research 50(7), 4054-4067 () [10.1093/nar/gkac202]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Secondary resistance to idelalisib is characterized by upregulation of IGF1R rather than MAPK/ERK pathway mutations.
Blood 139(22), 3340-3344 () [10.1182/blood.2021014550]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Modeling the B-cell receptor signaling on single cell level reveals a stable network circuit topology between non-malignant B cells and chronic lymphocytic leukemia cells and between untreated cells and cells treated with kinase inhibitors.
International journal of cancer 151(5), 783-796 () [10.1002/ijc.34112]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ; et al
The genomic and transcriptional landscape of primary central nervous system lymphoma.
Nature Communications 13(1), 2558 () [10.1038/s41467-022-30050-y]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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A synergistic interaction between HDAC- and PARP inhibitors in childhood tumors with chromothripsis.
International journal of cancer 151(4), 590-606 () [10.1002/ijc.34027]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Rapid, adaptable and sensitive Cas13-based COVID-19 diagnostics using ADESSO.
Nature Communications 13(1), 3308 () [10.1038/s41467-022-30862-y]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Comparative parallel multi-omics analysis during the induction of pluripotent and trophectoderm states.
Nature Communications 13(1), 3475 () [10.1038/s41467-022-31131-8]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
The HHIP-AS1 lncRNA promotes tumorigenicity through stabilization of dynein complex 1 in human SHH-driven tumors.
Nature Communications 13(1), 4061 () [10.1038/s41467-022-31574-z]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Comprehensive genomic and epigenomic analysis in cancer of unknown primary guides molecularly-informed therapies despite heterogeneity.
Nature Communications 13(1), 4485 () [10.1038/s41467-022-31866-4]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Exploration of whole genome and transcriptome sequencing data lacks evidence for oncogenic viral elements to drive the pathogenesis of T-cell prolymphocytic leukemia
Leukemia and lymphoma 63(13), 3253-3256 () [10.1080/10428194.2022.2116933]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
BCAT1 redox function maintains mitotic fidelity.
Cell reports 41(3), 111524 () [10.1016/j.celrep.2022.111524]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Proteogenomics refines the molecular classification of chronic lymphocytic leukemia.
Nature Communications 13(1), 6226 () [10.1038/s41467-022-33385-8]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
COGNITION: a prospective precision oncology trial for patients with early breast cancer at high risk following neoadjuvant chemotherapy.
ESMO open 7(6), 100637 () [10.1016/j.esmoop.2022.100637]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ; et al
Author Correction: Reconstructing evolutionary trajectories of mutation signature activities in cancer using TrackSig
Nature Communications 13(1), 7567 () [10.1038/s41467-022-32336-7]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ; et al
Author Correction: Combined burden and functional impact tests for cancer driver discovery using DriverPower
Nature Communications 13(1), 7571 () [10.1038/s41467-022-32343-8]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ; et al
Author Correction: Inferring structural variant cancer cell fraction
Nature Communications 13(1), 7568 () [10.1038/s41467-022-32338-5]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ; et al
Author Correction: A deep learning system accurately classifies primary and metastatic cancers using passenger mutation patterns
Nature Communications 13(1), 7573 () [10.1038/s41467-022-32329-6]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ; et al
Author Correction: Integrative pathway enrichment analysis of multivariate omics data
Nature Communications 13(1), 7570 () [10.1038/s41467-022-32342-9]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ; et al
Author Correction: High-coverage whole-genome analysis of 1220 cancers reveals hundreds of genes deregulated by rearrangement-mediated cis-regulatory alterations
Nature Communications 13(1), 7572 () [10.1038/s41467-022-32333-w]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ; et al
Author Correction: Divergent mutational processes distinguish hypoxic and normoxic tumours
Nature Communications 13(1), 7569 () [10.1038/s41467-022-32339-4]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png  ;  ;  ; et al
Author Correction: Pathway and network analysis of more than 2500 whole cancer genomes
Nature Communications 13(1), 7566 () [10.1038/s41467-022-32334-9]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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