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Data Science Seminar

The role of multiscale modeling in molecular discovery

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Abstract

Advanced statistical methods are rapidly impregnating many scientific fields, offering new perspectives on long-standing problems. In materials science, data-driven methods are already bearing fruit in various disciplines, such as hard condensed matter or inorganic chemistry, while comparatively little has happened in soft matter. I will describe how we use multiscale simulations to leverage data-driven methods in soft matter. We aim at establishing structure-property relationships for complex thermodynamic processes across the chemical space of small molecules. Akin to screening experiments, we devise a high-throughput coarse-grained simulation framework. Coarse-graining is an appealing screening strategy for two main reasons: it significantly reduces the size of chemical space and it can suggest a low-dimensional representation of the structure-property relationship. I will briefly mention a biological application of our methodology that led to the discovery of in vivo active compounds. Finally, I will mention a number of ways machine learning can help fulfill the promise of connecting models at different scales.

Biosketch

Tristan Bereau is a computational physicist working at the interface between multiscale modeling and machine learning for soft matter and biomolecules. He earned a Ph.D. in Physics at Carnegie Mellon University. After a postdoc at the University of Basel, he led an Emmy Noether research group at the Max Planck Institute for Polymer Research. He then moved to the University of Amsterdam as an assistant professor in chemistry and computer science, followed by a role in Industry. Tristan serves on the editorial boards of the journals Machine Learning: Science & Technnology and Computational Science and Engineering. He is currently a professor at the Institute for Theoretical Physics at the University of Heidelberg.

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