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Dr. Job van Riet

Journal Article Panten, J. (First author)DKFZ* ; Del Prete, S. (First author)DKFZ* ; Cleland, J. (First author)DKFZ* ; Saunders, L. M.DKFZ* ; van Riet, J.DKFZ* ; Schneider, A.DKFZ* ; Ginno, P.DKFZ* ; Schneider, N.DKFZ* ; Koch, M.-L.DKFZ* ; Chen, X. ; Gerstung, M.DKFZ* ; Stegle, O.DKFZ* ; Arnold, A. P. ; Turner, J. M. A. ; Heard, E. ; Odom, D. (Last author)DKFZ*
Four Core Genotypes mice harbour a 3.2MB X-Y translocation that perturbs Tlr7 dosage.
Nature Communications 15(1), 8814 (2024) [10.1038/s41467-024-52640-8]2024 DBCoverage Files Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Isebia, K. T. ; Lolkema, M. P. ; Jenster, G. ; de Wit, R. ; Martens, J. W. M. ; van Riet, J. (Last author)DKFZ*
A Compendium of AR Splice Variants in Metastatic Castration-Resistant Prostate Cancer.
International journal of molecular sciences 24(6), 6009 (2023) [10.3390/ijms24066009]2023 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Nakauma-González, J. A. ; Rijnders, M. ; van Riet, J.Extern* ; van der Heijden, M. S. ; Voortman, J. ; Cuppen, E. ; Mehra, N. ; van Wilpe, S. ; Oosting, S. F. ; Rijstenberg, L. L. ; Westgeest, H. M. ; Zwarthoff, E. C. ; de Wit, R. ; van der Veldt, A. A. M. ; van de Werken, H. J. G. ; Lolkema, M. P. J. ; Boormans, J. L.
Comprehensive Molecular Characterization Reveals Genomic and Transcriptomic Subtypes of Metastatic Urothelial Carcinoma
European urology 81(4), 331 - 336 (2022) [10.1016/j.eururo.2022.01.026]2022 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article van Riet, J.Extern* ; van de Werken, H. J. G. ; Cuppen, E. ; Eskens, F. A. L. M. ; Tesselaar, M. ; van Veenendaal, L. M. ; Klümpen, H.-J. ; Dercksen, M. W. ; Valk, G. D. ; Lolkema, M. P. ; Sleijfer, S. ; Mostert, B.
The genomic landscape of 85 advanced neuroendocrine neoplasms reveals subtype-heterogeneity and potential therapeutic targets
Nature Communications 12(1), 4612 (2021) [10.1038/s41467-021-24812-3]2021 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Doeveren, T. ; Nakauma-Gonzalez, J. A. ; Mason, A. S. ; Leenders, G. J. L. H. ; Zuiverloon, T. C. M. ; Zwarthoff, E. C. ; Meijssen, I. C. ; Made, A. C. ; Heijden, A. G. ; Hendricksen, K. ; Rhijn, B. W. G. ; Voskuilen, C. S. ; van Riet, J.Extern* ; Dinjens, W. N. M. ; Dubbink, H. J. ; Werken, H. J. G. ; Boormans, J. L.
The clonal relation of primary upper urinary tract urothelial carcinoma and paired urothelial carcinoma of the bladder
International journal of cancer 148(4), 981 - 987 (2021) [10.1002/ijc.33327]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Mendelaar, P. A. J. ; Smid, M. ; van Riet, J.Extern* ; Angus, L. ; Labots, M. ; Steeghs, N. ; Hendriks, M. P. ; Cirkel, G. A. ; van Rooijen, J. M. ; Ten Tije, A. J. ; Lolkema, M. P. ; Cuppen, E. ; Sleijfer, S. ; Martens, J. W. M. ; Wilting, S. M.
Whole genome sequencing of metastatic colorectal cancer reveals prior treatment effects and specific metastasis features
Nature Communications 12(1), 574 (2021) [10.1038/s41467-020-20887-6]2021 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Mout, L. ; van Dessel, L. F. ; Kraan, J. ; de Jong, A. C. ; Neves, R. P. L. ; Erkens-Schulze, S. ; Beaufort, C. M. ; Sieuwerts, A. M. ; van Riet, J.Extern* ; Woo, T. L. C. ; de Wit, R. ; Sleijfer, S. ; Hamberg, P. ; Sandberg, Y. ; te Boekhorst, P. A. W. ; van de Werken, H. J. G. ; Martens, J. W. M. ; Stoecklein, N. H. ; van Weerden, W. M. ; Lolkema, M. P.
Generating human prostate cancer organoids from leukapheresis enriched circulating tumour cells
European journal of cancer 150, 179 - 189 (2021) [10.1016/j.ejca.2021.03.023]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Kenter, A. T. ; Rentmeester, E. ; van Riet, J.Extern* ; Boers, R. ; Boers, J. ; Ghazvini, M. ; Xavier, V. J. ; Leenders, G. J. L. H. ; Verhagen, P. C. M. S. ; Til, M. E. ; Eussen, B. ; Losekoot, M. ; Klein, A. ; Peters, D. J. M. ; IJcken, W. F. J. ; Werken, H. J. G. ; Zietse, R. ; Hoorn, E. J. ; Jansen, G. ; Gribnau, J. H.
Cystic renal-epithelial derived induced pluripotent stem cells from polycystic kidney disease patients
Stem cells translational medicine 9(4), 478 - 490 (2020) [10.1002/sctm.18-0283]2020 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article de Jong, A. C. ; Smits, M. ; van Riet, J.Extern* ; Fütterer, J. J. ; Brabander, T. ; Hamberg, P. ; van Oort, I. M. ; de Wit, R. ; Lolkema, M. P. ; Mehra, N. ; Segbers, M. ; van der Veldt, A. A. M.
68 Ga-PSMA?Guided Bone Biopsies for Molecular Diagnostics in Patients with Metastatic Prostate Cancer
Journal of nuclear medicine 61(11), 1607 - 1614 (2020) [10.2967/jnumed.119.241109]2020 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article van Doeveren, T. ; van de Werken, H. J. G. ; van Riet, J.Extern* ; Aben, K. K. H. ; van Leeuwen, P. J. ; Zwarthoff, E. C. ; Boormans, J. L.
Synchronous and metachronous urothelial carcinoma of the upper urinary tract and the bladder: Are they clonally related? A systematic review
Urologic oncology 38(6), 590 - 598 (2020) [10.1016/j.urolonc.2020.01.008]2020 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Drabarek, W. ; Yavuzyigitoglu, S. ; Obulkasim, A. ; van Riet, J.Extern* ; Smit, K. N. ; van Poppelen, N. M. ; Vaarwater, J. ; Brands, T. ; Eussen, B. ; Verdijk, R. M. ; Naus, N. C. ; Mensink, H. W. ; Paridaens, D. ; Boersma, E. ; van de Werken, H. J. G. ; Kilic, E. ; de Klein, A.
Multi-Modality Analysis Improves Survival Prediction in Enucleated Uveal Melanoma Patients
Investigative ophthalmology & visual science 60(10), 3595 - (2019) [10.1167/iovs.18-24818]2019 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Dorssers, L. C. J. ; Gillis, A. J. M. ; Stoop, H. ; van Marion, R. ; Nieboer, M. M. ; van Riet, J.Extern* ; van de Werken, H. J. G. ; Oosterhuis, J. W. ; de Ridder, J. ; Looijenga, L. H. J.
Molecular heterogeneity and early metastatic clone selection in testicular germ cell cancer development
British journal of cancer 120(4), 444 - 452 (2019) [10.1038/s41416-019-0381-1]2019 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article van Dessel, L. F. ; van Riet, J.Extern* ; Smits, M. ; Zhu, Y. ; Hamberg, P. ; van der Heijden, M. S. ; Bergman, A. M. ; van Oort, I. M. ; de Wit, R. ; Voest, E. E. ; Steeghs, N. ; Yamaguchi, T. N. ; Livingstone, J. ; Boutros, P. C. ; Martens, J. W. M. ; Sleijfer, S. ; Cuppen, E. ; Zwart, W. ; van de Werken, H. J. G. ; Mehra, N. ; Lolkema, M. P.
The genomic landscape of metastatic castration-resistant prostate cancers reveals multiple distinct genotypes with potential clinical impact
Nature Communications 10(1), 5251 (2019) [10.1038/s41467-019-13084-7]2019 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Angus, L. ; Smid, M. ; Wilting, S. M. ; van Riet, J.Extern* ; Van Hoeck, A. ; Nguyen, L. ; Nik-Zainal, S. ; Steenbruggen, T. G. ; Tjan-Heijnen, V. C. G. ; Labots, M. ; van Riel, J. M. G. H. ; Bloemendal, H. J. ; Steeghs, N. ; Lolkema, M. P. ; Voest, E. E. ; van de Werken, H. J. G. ; Jager, A. ; Cuppen, E. ; Sleijfer, S. ; Martens, J. W. M.
The genomic landscape of metastatic breast cancer highlights changes in mutation and signature frequencies
Nature genetics 51(10), 1450 - 1458 (2019) [10.1038/s41588-019-0507-7]2019 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Mehra, N. ; van Riet, J.Extern* ; Smits, M. ; Westdorp, H. ; Gorris, M. ; van Ee, T. ; van der Doelen, M. ; van Oort, I. ; Sedelaar, M. ; Textor, J. ; Cuppen, E. ; Grunberg, K. ; Ligtenberg, M. J. L. ; Zwart, W. ; Bergman, A. ; van de Werken, H. J. G. ; Schalken, J. ; de Vries, I. J. M. ; Lolkema, M. P. ; Gerritsen, W. R.
In-depth assessment of metastatic prostate cancer with high tumour mutational burden
Annals of oncology 29(8), 274 (2018) [10.1093/annonc/mdy284.007]2018 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article van Riet, J.Extern* ; Krol, N. M. G. ; Atmodimedjo, P. N. ; Brosens, E. ; van IJcken, W. F. J. ; Jansen, M. P. H. M. ; Martens, J. W. M. ; Looijenga, L. H. ; Jenster, G. ; Dubbink, H. J. ; Dinjens, W. N. M. ; van de Werken, H. J. G.
SNPitty. An Intuitive Web Application for Interactive B-AlleleFrequency and Copy Number Visualization ofNext-Generation Sequencing Data
The journal of molecular diagnostics 20(2), 166 - 176 (2018) [10.1016/j.jmoldx.2017.11.011]2018 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Smid, M. ; Coebergh van den Braak, R. R. J. ; van de Werken, H. J. G. ; van Riet, J.Extern* ; van Galen, A. ; de Weerd, V. ; van der Vlugt-Daane, M. ; Bril, S. I. ; Lalmahomed, Z. S. ; Kloosterman, W. P. ; Wilting, S. M. ; Foekens, J. A. ; IJzermans, J. N. M. ; Martens, J. W. M. ; Sieuwerts, A. M.
Gene length corrected trimmed mean of M-values (GeTMM) processing of RNA-seq data performs similarly in intersample analyses while improving intrasample comparisons
BMC bioinformatics 19(1), 236 (2018) [10.1186/s12859-018-2246-7]2018 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Meijer, T. G. ; Verkaik, N. S. ; Sieuwerts, A. M. ; van Riet, J.Extern* ; Naipal, K. A. T. ; van Deurzen, C. H. M. ; den Bakker, M. A. ; Sleddens, H. F. B. M. ; Dubbink, H.-J. ; den Toom, T. D. ; Dinjens, W. N. M. ; Lips, E. ; Nederlof, P. M. ; Smid, M. ; van de Werken, H. J. G. ; Kanaar, R. ; Martens, J. W. M. ; Jager, A. ; van Gent, D. C.
Functional Ex Vivo Assay Reveals Homologous Recombination Deficiency in Breast Cancer Beyond BRCA Gene Defects
Clinical cancer research 24(24), 6277 - 6287 (2018) [10.1158/1078-0432.CCR-18-0063]2018 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Yavuzyigitoglu, S. ; Drabarek, W. ; Smit, K. N. ; van Poppelen, N. ; Koopmans, A. E. ; Vaarwater, J. ; Brands, T. ; Eussen, B. ; Dubbink, H. J. ; van Riet, J.Extern* ; van de Werken, H. J. G. ; Beverloo, B. ; Verdijk, R. M. ; Naus, N. ; Paridaens, D. ; Kilic, E. ; de Klein, A.
Correlation of Gene Mutation Status with Copy Number Profile in Uveal Melanoma
Ophthalmology 124(4), 573 - 575 (2017) [10.1016/j.ophtha.2016.10.039]2017 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Journal Article Mohd-Sarip, A. ; Teeuwssen, M. ; Bot, A. G. ; De Herdt, M. J. ; Willems, S. M. ; Baatenburg de Jong, R. J. ; Looijenga, L. H. J. ; Zatreanu, D. ; Bezstarosti, K. ; van Riet, J.Extern* ; Oole, E. ; van Ijcken, W. F. J. ; van de Werken, H. J. G. ; Demmers, J. A. ; Fodde, R. ; Verrijzer, C. P.
DOC1-Dependent Recruitment of NURD Reveals Antagonism with SWI/SNF during Epithelial-Mesenchymal Transition in Oral Cancer Cells
Cell reports 20(1), 61 - 75 (2017) [10.1016/j.celrep.2017.06.020]2017 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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