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Prof. Dr. Moritz Gerstung

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article (Review Article)  ;  ;  ;
Artificial intelligence in histopathology: enhancing cancer research and clinical oncology.
Nature cancer 3(9), 1026 - 1038 () [10.1038/s43018-022-00436-4]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Computational analysis of peripheral blood smears detects disease-associated cytomorphologies
[10.1101/2022.04.19.22273757]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;
Estimation of the test to test distribution as a proxy for generation interval distribution for the Omicron variant in England
[10.1101/2022.01.08.22268920]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
p53 mutation in normal esophagus promotes multiple stages of carcinogenesis but is constrained by clonal competition
[10.1101/2022.02.03.478951]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;
Biallelic mutations in cancer genomes reveal local mutational determinants.
Nature genetics 54(2), 128 - 133 () [10.1038/s41588-021-01005-8]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article (Erratum/Correction)  ;  ;  ; et al
Publisher Correction: Genomic reconstruction of the SARS CoV-2 epidemic in England
Nature <London> 606(7915), E18 - E18 () [10.1038/s41586-022-04887-8]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
The longitudinal dynamics and natural history of clonal haematopoiesis.
Nature <London> 606(7913), 335-342 () [10.1038/s41586-022-04785-z]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Somatic mutation rates scale with lifespan across mammals.
Nature <London> 604(7906), 517 - 524 () [10.1038/s41586-022-04618-z]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Cell2location maps fine-grained cell types in spatial transcriptomics
Nature biotechnology 40(5), 661-671 () [10.1038/s41587-021-01139-4]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
The longitudinal dynamics and natural history of clonal haematopoiesis
[10.1038/s41586-022-04785-z]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ; et al
Characterizing genetic intra-tumor heterogeneity across 2,658 human cancer genomes
Cell 184(8), 2239 - 2254.e39 () [10.1016/j.cell.2021.03.009]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Life without mismatch repair
[10.1101/2021.04.14.437578]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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PoSTcode: Probabilistic image-based spatial transcriptomics decoder
[10.1101/2021.10.12.464086]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Notch1 mutation drives clonal expansion in normal esophageal epithelium but impairs tumor growth
[10.1101/2021.06.18.448956]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Spatial genomics maps the structure, character and evolution of cancer clones
[10.1101/2021.04.16.439912]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Somatic mutation landscapes at single-molecule resolution.
Nature <London> 593(7859), 405 - 410 () [10.1038/s41586-021-03477-4]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Protection of the C. elegans germ cell genome depends on diverse DNA repair pathways during normal proliferation.
PLOS ONE 16(4), e0250291 - () [10.1371/journal.pone.0250291]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Patterns of within-host genetic diversity in SARS-CoV-2.
eLife 10, e66857 () [10.7554/eLife.66857]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Mutant clones in normal epithelium outcompete and eliminate emerging tumours.
Nature <London> 598(7881), 510 - 514 () [10.1038/s41586-021-03965-7]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
C. elegans genome-wide analysis reveals DNA repair pathways that act cooperatively to preserve genome integrity upon ionizing radiation.
PLOS ONE 16(10), e0258269 - () [10.1371/journal.pone.0258269]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;
Learning mutational signatures and their multidimensional genomic properties with TensorSignatures
Nature Communications 12(1), 3628 () [10.1038/s41467-021-23551-9]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Lineage-defined leiomyosarcoma subtypes emerge years before diagnosis and determine patient survival.
Nature Communications 12(1), 4496 () [10.1038/s41467-021-24677-6]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Somatic mutation rates scale with lifespan across mammals
bioRxiv beta () [https://doi.org/10.1101/2021.08.19.456982]  GO   Download fulltextFulltext BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Genomic reconstruction of the SARS-CoV-2 epidemic in England.
Nature <London> 600(7889), 506-511 () [10.1038/s41586-021-04069-y]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Mutational signatures are jointly shaped by DNA damage and repair
[10.1101/686295]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Pan-cancer computational histopathology reveals mutations, tumor composition and prognosis
[10.1101/813543]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Genomic copy number predicts oesophageal cancer years before transformation
[10.1101/2020.02.27.967612]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Patterns of within-host genetic diversity in SARS-CoV-2
[10.1101/2020.12.23.424229]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ; et al
Sex differences in oncogenic mutational processes
Nature Communications 11(1), 4330 () [10.1038/s41467-020-17359-2]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Systematic analysis of mutational spectra associated with DNA repair deficiency in C. elegans
[10.1101/2020.06.04.133306]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Comprehensive mapping of tissue cell architecture via integrated single cell and spatial transcriptomics
[10.1101/2020.11.15.378125]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Mutational signatures are jointly shaped by DNA damage and repair
Nature Communications 11(1), 2169 () [10.1038/s41467-020-15912-7]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ; et al
Inferring structural variant cancer cell fraction.
Nature Communications 11(1), 730 () [10.1038/s41467-020-14351-8]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Mutational signatures are jointly shaped by DNA damage and repair.
Nature Communications 11(1), 2169 () [10.1038/s41467-020-15912-7]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Pan-cancer computational histopathology reveals mutations, tumor composition and prognosis
Nature cancer 1(8), 800 - 810 () [10.1038/s43018-020-0085-8]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;
Analysis of mutational signatures in C. elegans: Implications for cancer genome analysis.
DNA repair 95, 102957 () [10.1016/j.dnarep.2020.102957]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article (Letter)  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Genomic copy number predicts esophageal cancer years before transformation.
Nature medicine 26(11), 1726 - 1732 () [10.1038/s41591-020-1033-y]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Extensive heterogeneity in somatic mutation and selection in the human bladder.
Science / Science now 370(6512), 75 - 82 () [10.1126/science.aba8347]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Spatial competition shapes the dynamic mutational landscape of normal esophageal epithelium.
Nature genetics 52(6), 604 - 614 () [10.1038/s41588-020-0624-3]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ; et al
Reconstructing evolutionary trajectories of mutation signature activities in cancer using TrackSig.
Nature Communications 11(1), 731 () [10.1038/s41467-020-14352-7]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ; et al
Retrospective evaluation of whole exome and genome mutation calls in 746 cancer samples.
Nature Communications 11(1), 4748 () [10.1038/s41467-020-18151-y]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ; et al
Pan-cancer analysis of whole genomes.
Nature <London> 578(7793), 82 - 93 () [10.1038/s41586-020-1969-6]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ; et al
The evolutionary history of 2,658 cancers.
Nature <London> 578(7793), 122 - 128 () [10.1038/s41586-019-1907-7]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;
Learning mutational signatures and their multidimensional genomic properties with TensorSignatures
[10.1101/850453]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Genomic landscape and chronological reconstruction of driver events in multiple myeloma.
Nature Communications 10(1), 3835 () [10.1038/s41467-019-11680-1]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Cohesin-dependent regulation of gene expression during differentiation is lost in cohesin-mutated myeloid malignancies
Blood 134(24), 2195 - 2208 () [10.1182/blood.2019001553]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Characterizing genetic intra-tumor heterogeneity across 2,658 human cancer genomes
[10.1101/312041]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Genomic landscape and chronological reconstruction of driver events in multiple myeloma
[10.1101/388611]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article (Letter)  ;  ;  ; et al
Neutral tumor evolution?
Nature genetics 50(12), 1630 - 1633 () [10.1038/s41588-018-0258-x]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Process-specific somatic mutation distributions vary with three-dimensional genome structure
[10.1101/426080]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;
Immuno-oncology from the perspective of somatic evolution.
Seminars in cancer biology 52(Pt 2), 75 - 85 () [10.1016/j.semcancer.2017.12.001]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Mutational signatures of DNA mismatch repair deficiency in C. elegans and human cancers.
Genome research 28(5), 666 - 675 () [10.1101/gr.226845.117]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Analysis of the genomic landscape of multiple myeloma highlights novel prognostic markers and disease subgroups.
Leukemia 32(12), 2604 - 2616 () [10.1038/s41375-018-0037-9]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article (Erratum/Correction)  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Universal Patterns of Selection in Cancer and Somatic Tissues.
Cell 173(7), 1823 - () [10.1016/j.cell.2018.06.001]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ; et al
Identification of Prognostic Phenotypes of Esophageal Adenocarcinoma in 2 Independent Cohorts.
Gastroenterology 155(6), 1720 - 1728.e4 () [10.1053/j.gastro.2018.08.036]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Classification and Personalized Prognosis in Myeloproliferative Neoplasms.
The New England journal of medicine 379(15), 1416 - 1430 () [10.1056/NEJMoa1716614]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Prediction of acute myeloid leukaemia risk in healthy individuals.
Nature <London> 559(7714), 400 - 404 () [10.1038/s41586-018-0317-6]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Somatic mutations reveal asymmetric cellular dynamics in the early human embryo.
Nature <London> 543(7647), 714 - 718 () [10.1038/nature21703]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Precision oncology for acute myeloid leukemia using a knowledge bank approach.
Nature genetics 49(3), 332 - 340 () [10.1038/ng.3756]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Genomic Evolution of Breast Cancer Metastasis and Relapse.
Cancer cell 32(2), 169 - 184.e7 () [10.1016/j.ccell.2017.07.005]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Societal challenges of precision medicine: Bringing order to chaos.
European journal of cancer 84, 325 - 334 () [10.1016/j.ejca.2017.07.028]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Universal Patterns of Selection in Cancer and Somatic Tissues.
Cell 171(5), 1029 - 1041.e21 () [10.1016/j.cell.2017.09.042]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
A High Density Map for Navigating the Human Polycomb Complexome
[10.1101/059964]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Preprint  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Personally tailored cancer management based on knowledge banks of genomic and clinical data
[10.1101/057497]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Landscape of somatic mutations in 560 breast cancer whole-genome sequences.
Nature <London> 534(7605), 47 - 54 () [10.1038/nature17676]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Genomic Classification and Prognosis in Acute Myeloid Leukemia
The New England journal of medicine 374(23), 2209 - 2221 () [10.1056/NEJMoa1516192]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
A High-Density Map for Navigating the Human Polycomb Complexome.
Cell reports 17(2), 583 - 595 () [10.1016/j.celrep.2016.08.096]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
RUNX1 mutations in acute myeloid leukemia are associated with distinct clinico-pathologic and genetic features
Leukemia 30(11), 2160 - 2168 () [10.1038/leu.2016.126]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article (Erratum/Correction)  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Erratum: RUNX1 mutations in acute myeloid leukemia are associated with distinct clinico-pathologic and genetic features
Leukemia 30(11), 2282 - 2282 () [10.1038/leu.2016.207]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Combining gene mutation with gene expression data improves outcome prediction in myelodysplastic syndromes
Nature Communications 6(1), 5901 () [10.1038/ncomms6901]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Cancer evolution: mathematical models and computational inference.
Systematic biology 64(1), e1 - e25 () [10.1093/sysbio/syu081]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article (Letter)  ;  ;  ; et al
Combined hereditary and somatic mutations of replication error repair genes result in rapid onset of ultra-hypermutated cancers
Nature genetics 47(3), 257 - 262 () [10.1038/ng.3202]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Tumor evolution. High burden and pervasive positive selection of somatic mutations in normal human skin.
Science / Science now 348(6237), 880 - 886 () [10.1126/science.aaa6806]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Frequent somatic transfer of mitochondrial DNA into the nuclear genome of human cancer cells.
Genome research 25(6), 814 - 824 () [10.1101/gr.190470.115]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Subclonal diversification of primary breast cancer revealed by multiregion sequencing.
Nature medicine 21(7), 751 - 759 () [10.1038/nm.3886]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;
Subclonal variant calling with multiple samples and prior knowledge.
Bioinformatics 30(9), 1198 - 1204 () [10.1093/bioinformatics/btt750]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Mobile DNA in cancer. Extensive transduction of nonrepetitive DNA mediated by L1 retrotransposition in cancer genomes.
Science / Science now 345(6196), 1251343 () [10.1126/science.1251343]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Origins and functional consequences of somatic mitochondrial DNA mutations in human cancer.
eLife 3, e02935 () [10.7554/eLife.02935]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Kinetic, energetic, and mechanical differences between dark-state rhodopsin and opsin.
Structure 21(3), 426 - 437 () [10.1016/j.str.2013.01.011]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Clinical and biological implications of driver mutations in myelodysplastic syndromes.
Blood 122(22), 3616 - 3627 () [10.1182/blood-2013-08-518886]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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The BET protein FSH functionally interacts with ASH1 to orchestrate global gene activity in Drosophila.
Genome biology 14(2), R18 () [10.1186/gb-2013-14-2-r18]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Genome-wide expression and copy number analysis identifies driver genes in gingivobuccal cancers.
Genes, chromosomes & cancer 51(2), 161 - 173 () [10.1002/gcc.20940]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Reliable detection of subclonal single-nucleotide variants in tumour cell populations.
Nature Communications 3(1), 811 () [10.1038/ncomms1814]  GO DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;
Polycomb preferentially targets stalled promoters of coding and noncoding transcripts.
Genome research 21(2), 216 - 226 () [10.1101/gr.114348.110]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Clinicopathological and prognostic implications of genetic alterations in oral cancers.
Oncology letters 2(3), 445 - 451 () [10.3892/ol.2011.271]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Evolutionary Games with Affine Fitness Functions: Applications to Cancer
Dynamic games and applications 1(3), 370 - 385 () [10.1007/s13235-011-0029-0]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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The temporal order of genetic and pathway alterations in tumorigenesis.
PLOS ONE 6(11), e27136 () [10.1371/journal.pone.0027136]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Genomic profiling of advanced-stage oral cancers reveals chromosome 11q alterations as markers of poor clinical outcome.
PLOS ONE 6(2), e17250 () [10.1371/journal.pone.0017250]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Waiting Time Models of Cancer Progression
Mathematical population studies 17(3), 115 - 135 () [10.1080/08898480.2010.490994]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Noisy signaling through promoter logic gates.
Physical review / E 79(1 Pt 1), 011923 () [10.1103/PhysRevE.79.011923]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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Quantifying cancer progression with conjunctive Bayesian networks.
Bioinformatics 25(21), 2809 - 2815 () [10.1093/bioinformatics/btp505]  GO pmc   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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A quantitative and dynamic model for plant stem cell regulation.
PLOS ONE 3(10), e3553 () [10.1371/journal.pone.0003553]  GO DBCoverage   Download fulltextFulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

http://join2-wiki.gsi.de/foswiki/pub/Main/Artwork/join2_logo100x88.png Journal Article  ;  ;  ;  ;  ;  ;
Control of plant organ size by KLUH/CYP78A5-dependent intercellular signaling.
Developmental cell 13(6), 843 - 856 () [10.1016/j.devcel.2007.10.001]  GO BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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