Krebsgenomforschung
- DKTK
- Funktionelle und Strukturelle Genomforschung
Prof. Dr. Holger Sültmann
Leitung
Die Evolution von Krebs ist mit weitreichenden molekularen Veränderungen des Genoms, des Epigenoms und der Expression von Genen verbunden. Die Ziele der Abteilung sind die Identifizierung dieser molekularen Marker, sie für die Diagnose, Prognose und Vorhersage des Therapie-Ansprechens bei Krebspatienten einzusetzen und ihre Rolle bei der Entstehung und Progression von Tumoren zu verstehen.
Bild: Forschungsinhalte Abteilung Krebsgenomforschung am DKFZ, © DKFZ, Abteilung Krebsgenomforschung
Projekte
Liquid Biopsy zur nichtinvasiven Tumorüberwachung
Wir haben unsere Liquid-Biopsy-Ansätze erweitert und weiterentwickelt, um Technologien für die Tumorüberwachung und den Nachweis von minimaler Resterkrankung („minimal residual disease“, MRD) zu etablieren und anzuwenden. Zu diesem Zweck haben wir ca. 500 longitudinale Plasmaproben von ALK-Fusions-positiven Lungenkrebspatienten (in Zusammenarbeit mit der Thoraxklinik Heidelberg) als Machbarkeitsstudie verwendet, um:
- Einzelnukleotid-Varianten (SNVs) und Kopienzahlvarianten in Plasma-DNA zu bestimmen,
- molekulare Daten mit klinischen Parametern wie Oligoprogression zu korrelieren
- zu zeigen, dass die molekulare Vorlaufzeit bis zum Fortschreiten unter Therapie kürzer ist als die radiologische Vorlaufzeit,
- epigenomische Varianten zur Erkennung von Tumorprogression und MRD zu identifizieren.
Weitere Quellen:
Tumoren mittels Blutprobe auf der Spur: https://www.youtube.com/watch?v=rpGLAdQBCdk
Methods for ctDNA detection and analysis: https://youtu.be/pwK1BTlQl6w
Kooperationen:
- Thoraxonkologie, Thoraxklinik Heidelberg
- Pathologisches Institut, Universitätsklinikum Heidelberg
- Gynäkologische Onkologie, NCT Heidelberg
- Abteilung Molekulare Genetik, DKFZ Heidelberg
- Abteilung Radioonkologie, Universitätsklinikum Heidelberg
- Klinik für Hämatologie und Onkologie und Institut für Ernährungsmedizin, Universitätsklinikum Schleswig-Holstein, Campus Lübeck
Unterstützung: Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) in den Förderprogrammen Deutsches Zentrum für Lungenforschung (DZL), OUTLIVE-CRC, und SATURN3
Team
Die Mitarbeitenden in der Abteilung besitzen Erfahrungen in Molekular- und Zellbiologie, Medizin oder KI-gestützten Datenanalysen. Unser Ziel ist die Erforschung von Therapieresistenz und die Translation von molekularen Markern in die klinische Diagnostik.
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Prof. Dr. Holger Sültmann
Leitung
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Dr. Isabell Berneburg
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Priv. Doz. Dr. Petros Christopoulos
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Michela De Meo
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Simay Dolaner
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Sabrina Gerhardt
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Dr. Kate Glennon
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Myesha Jahin
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Dr. Florian Janke
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Priv. Doz. Dr. Sabine Klauck
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Dr. Astrid Laut
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Simon John Ogrodnik
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Luca Sebastian Schulte
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Dr. Rebecca Schunk
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Dr. Andrey Turchinovich
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