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Publications

Selected publications:

Amouzgar M*, Glass DR*, Baskar R, Averbukh I, Kimmey SC, Tsai AG, Hartmann FJ, Bendall SC (2022). Supervised dimensionality reduction for exploration of single-cell data by HSS-LDA. Patterns. 100536.

Geeraerts X, Fernandez-Garcia J, Hartmann FJ, de Goede KE, Martens L, Elkrim Y, et al. Macrophages are metabolically heterogeneous within the tumor microenvironment. Cell Rep. 2021;37(13):110171.

Alspach E, Chow RD, Demehri S, Guerriero JL, Gujar S, Hartmann FJ, et al. Supporting the Next Generation of Scientists to Lead Cancer Immunology Research. Cancer Immunol Res. 2021;9(11):1245-51

Hartmann FJ, Mrdjen D, McCaffrey E, Glass DR, Greenwald NF, Bharadwaj A, Khair Z, Verberk SGS, Baranski A, Baskar R, Graf W, Van Valen D, Van den Bossche J, Angelo M, Bendall SC. Single-cell metabolic profiling of human cytotoxic T cells. Nat Biotechnol. 2021 Feb;39(2):186-197.

Ackerman SE, Pearson CI, Gregorio JD, Gonzalez JC, Kenkel JA, Hartmann FJ, et al. Immune-stimulating antibody conjugates elicit robust myeloid activation and durable antitumor immunity. Nat Cancer. 2021;2(1):18-33

Glass DR, Tsai AG, Oliveria JP, Hartmann FJ, Kimmey SC, Calderon AA, et al. An Integrated Multi-omic Single-Cell Atlas of Human B Cell Identity. Immunity. 2020;53(1):217-32 e5.

Hartmann FJ, Bendall SC. Immune monitoring using mass cytometry and related high-dimensional imaging approaches. Nat Rev Rheumatol. 2020 Feb;16(2):87-99

Galli E*, Hartmann FJ*, Schreiner B, Ingelfinger F, Arvaniti E, Diebold M, Mrdjen D, van der Meer F, Krieg C, Nimer FA, Sanderson N, Stadelmann C, Khademi M, Piehl F, Claassen M, Derfuss T, Olsson T, Becher B. GM-CSF and CXCR4 define a T helper cell signature in multiple sclerosis. Nat Med. 2019 Aug;25(8):1290-1300

Hartmann FJ, Babdor J, Gherardini PF, Amir ED, Jones K, Sahaf B, Marquez DM, Krutzik P, O'Donnell E, Sigal N, Maecker HT, Meyer E, Spitzer MH, Bendall SC. Comprehensive Immune Monitoring of Clinical Trials to Advance Human Immunotherapy. Cell Rep. 2019 Jul 16;28(3):819-831.e4

Hartmann FJ, Simonds EF, Bendall SC. A Universal Live Cell Barcoding-Platform for Multiplexed Human Single Cell Analysis. Sci Rep. 2018;8(1):10770.

Krieg C, Nowicka M, Guglietta S, Schindler S, Hartmann FJ, Weber LM, et al. High-dimensional single-cell analysis predicts response to anti-PD-1 immunotherapy. Nat Med. 2018;24(2):144-53.

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