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Publications 2021

Schult, T. A. ; Lauer, M. J. ; Berker, Y. ; Cardoso, M. R. ; Vandergrift, L. A. ; Habbel, P. ; Nowak, J. ; Taupitz, M. ; Aryee, M. ; Mino-Kenudson, M. A. ; Christiani, D. C. ; Cheng, L. L.
Screening human lung cancer with predictive models of serum magnetic resonance spectroscopy metabolomics.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 118(51), e2110633118 - (2021) [10.1073/pnas.2110633118]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Mynarek, M. ; Milde, T. ; Padovani, L. ; Janssens, G. O. ; Kwiecien, R. ; Mosseri, V. ; Clifford, S. C. ; Doz, F. ; Rutkowski, S.
SIOP PNET5 MB Trial: History and Concept of a Molecularly Stratified Clinical Trial of Risk-Adapted Therapies for Standard-Risk Medulloblastoma
Cancers 13(23), 6077 (2021) [10.3390/cancers13236077]2021 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Barenboim, M. ; Kovac, M. ; Ameline, B. ; Jones, D. T. W. ; Witt, O. ; Bielack, S. ; Burdach, S. ; Baumhoer, D. ; Nathrath, M.
DNA methylation-based classifier and gene expression signatures detect BRCAness in osteosarcoma.
PLoS Computational Biology 17(11), e1009562 - (2021) [10.1371/journal.pcbi.1009562]2021 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Adolph, J. E. ; Fleischhack, G. ; Gaab, C. ; Mikasch, R. ; Mynarek, M. ; Rutkowski, S. ; Schüller, U. ; Pfister, S. M. ; Pajtler, K. ; Milde, T. ; Witt, O. ; Bison, B. ; Warmuth-Metz, M. ; Kortmann, R.-D. ; Dietzsch, S. ; Pietsch, T. ; Timmermann, B. ; Tippelt, S. ; HIT-Network, G. G. (Collaboration Author)
Systemic chemotherapy of pediatric recurrent ependymomas: results from the German HIT-REZ studies.
Journal of neuro-oncology 155(2), 193-202 (2021) [10.1007/s11060-021-03867-8]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Sievers, P. (First author) ; Stichel, D. (First author) ; Sill, M. ; Schrimpf, D. ; Sturm, D. ; Selt, F. ; Ecker, J. ; Kazdal, D. ; Miele, E. ; Kranendonk, M. E. G. ; Tops, B. B. J. ; Kohlhof-Meinecke, P. ; Beschorner, R. ; Kramm, C. M. ; Hasselblatt, M. ; Reifenberger, G. ; Capper, D. ; Wesseling, P. ; Stenzinger, A. ; Milde, T. ; Korshunov, A. ; Witt, O. ; Pfister, S. M. ; Wick, W. ; von Deimling, A. ; Jones, D. T. W. ; Sahm, F. (Last author)
GOPC:ROS1 and other ROS1 fusions represent a rare but recurrent drug target in a variety of glioma types.
Acta neuropathologica 142(6), 1065-1069 (2021) [10.1007/s00401-021-02369-1]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Deng, M. Y. (First author) ; Sturm, D. (First author) ; Pfaff, E. (First author) ; Sill, M. ; Stichel, D. ; Balasubramanian, G. P. ; Tippelt, S. ; Kramm, C. ; Donson, A. M. ; Green, A. L. ; Jones, C. ; Schittenhelm, J. ; Ebinger, M. ; Schuhmann, M. U. ; Jones, B. C. ; van Tilburg, C. M. ; Wittmann, A. ; Golanov, A. ; Ryzhova, M. ; Ecker, J. ; Milde, T. ; Witt, O. ; Sahm, F. ; Reuss, D. ; Sumerauer, D. ; Zamecnik, J. ; Korshunov, A. ; von Deimling, A. ; Pfister, S. M. ; Jones, D. (Last author)
Radiation-induced gliomas represent H3-/IDH-wild type pediatric gliomas with recurrent PDGFRA amplification and loss of CDKN2A/B.
Nature Communications 12(1), 5530 (2021) [10.1038/s41467-021-25708-y]2021 DBCoverage Fulltext by Pubmed Central BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Müller, M. (First author) ; Rösch, L. ; Najafi, S. ; Gatzweiler, C. ; Ridinger, J. ; Gerloff, X. F. ; Jones, D. T. W. ; Baßler, J. ; Kreth, S. ; Stainczyk, S. ; Frese, K. ; Meder, B. ; Westermann, F. ; Milde, T. ; Peterziel, H. ; Witt, O. ; Oehme, I. (Last author)
Combining APR-246 and HDAC-Inhibitors: A Novel Targeted Treatment Option for Neuroblastoma.
Cancers 13(17), 4476 (2021) [10.3390/cancers13174476]2021 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Alhalabi, K. T. (First author) ; Stichel, D. ; Sievers, P. ; et al
PATZ1 fusions define a novel molecularly distinct neuroepithelial tumor entity with a broad histological spectrum.
Acta neuropathologica 142(5), 841-857 (2021) [10.1007/s00401-021-02354-8]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

van Tilburg, C. M. ; Pfaff, E. ; Pajtler, K. W. ; et al
The pediatric precision oncology INFORM registry: clinical outcome and benefit for patients with very high-evidence targets.
Cancer discovery 11(11), 2764-2779 (2021) [10.1158/2159-8290.CD-21-0094]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Steinbügl, M. ; Nemes, K. ; Johann, P. ; Kröncke, T. ; Tüchert, S. ; da Costa, M. J. G. ; Ebinger, M. ; Schüller, U. ; Sehested, A. ; Hauser, P. ; Reinhard, H. ; Sumerauer, D. ; Hettmer, S. ; Jakob, M. ; Hasselblatt, M. ; Siebert, R. ; Witt, O. ; Gerss, J. ; Kerl, K. ; Frühwald, M. C.
Clinical evidence for a biological effect of epigenetically active decitabine in relapsed or progressive rhabdoid tumors.
Pediatric blood & cancer 68(12), e29267 (2021) [10.1002/pbc.29267]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Milde, T. (First author) ; Rodriguez, F. J. ; Barnholtz-Sloan, J. S. ; Patil, N. ; Eberhart, C. G. ; Gutmann, D. H.
Reimagining Pilocytic Astrocytomas in the Context of Pediatric Low-Grade Gliomas.
Neuro-Oncology 23(10), 1634-1646 (2021) [10.1093/neuonc/noab138]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Vassal, G. ; Houghton, P. J. ; Pfister, S. M. ; Smith, M. A. ; Caron, H. N. ; Li, X.-N. ; Shields, D. J. ; Witt, O. ; Molenaar, J. J. ; Colombetti, S. ; Schuler, J. ; Stancato, L. F.
International consensus on minimum preclinical testing requirements for the development of innovative therapies for children and adolescents with cancer.
Molecular cancer therapeutics 20(8), 1462-1468 (2021) [10.1158/1535-7163.MCT-20-0394]2021 Files BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Beck, L. (First author) ; Witt, R. ; Nesper-Brock, M. ; Milde, T. ; Hettmer, S. ; Frühwald, M. C. ; Rössig, C. ; Fischer, M. ; Reinhardt, D. ; Taylor, L. A. ; Riedel, C. ; Witt, O. ; van Tilburg, C. M. (Last author)
A Study of Regulatory Challenges of Paediatric Oncology Phase I/II Trial Submissions and Guidance on Protocol Development.
Clinical pharmacology & therapeutics 110(4), 1025-1037 (2021) [10.1002/cpt.2319]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Klionsky, D. J. ; Abdel-Aziz, A. K. ; Abdelfatah, S. ; et al
Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy (4th edition) 1
Autophagy 17(1), 1 - 382 (2021) [10.1080/15548627.2020.1797280]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Gnekow, A. K. ; Kandels, D. ; Pietsch, T. ; Bison, B. ; Warmuth-Metz, M. ; Thomale, U. W. ; Kortmann, R.-D. ; Timmermann, B. ; Driever, P. H. ; Witt, O. ; Schmidt, R. ; Spix, C.
Doubling Recruitment of Pediatric Low-grade Glioma within Two Decades does not change Outcome - Report from the German LGG Studies [Verdopplung der Rekrutierungszahl niedrig-gradiger Gliome des Kindes- und Jugendalters innerhalb von 20 Jahren ändert die Überlebenschancen nicht.]
Klinische Pa?diatrie 233(3), 107 - 122 (2021) [10.1055/a-1471-5897]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Kovac, M. ; Ameline, B. ; Ribi, S. ; Kovacova, M. ; Cross, W. ; Barenboim, M. ; Witt, O. ; Bielack, S. ; Krieg, A. ; Hartmann, W. ; Nathrath, M. ; Baumhoer, D.
The early evolutionary landscape of osteosarcoma provides clues for targeted treatment strategies.
The journal of pathology 254(5), 556-566 (2021) [10.1002/path.5699]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Körholz, K. (First author) ; Ridinger, J. ; Krunic, D. ; Najafi, S. ; Gerloff, X. F. ; Frese, K. ; Meder, B. ; Peterziel, H. ; Vega-Rubin-de-Celis, S. ; Witt, O. ; Oehme, I. (Last author)
Broad-Spectrum HDAC Inhibitors Promote Autophagy through FOXO Transcription Factors in Neuroblastoma.
Cells 10(5), 1001 (2021) [10.3390/cells10051001]2021 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Zheng, T. (First author) ; Ghasemi, D. R. (First author) ; Okonechnikov, K. (First author) ; Korshunov, A. ; Sill, M. ; Maass, K. K. ; Benites Goncalves da Silva, P. ; Ryzhova, M. ; Gojo, J. ; Stichel, D. ; Arabzade, A. ; Kupp, R. ; Benzel, J. ; Taya, S. ; Adachi, T. ; Shiraishi, R. ; Gerber, N. U. ; Sturm, D. ; Ecker, J. ; Sievers, P. ; Selt, F. ; Chapman, R. ; Haberler, C. ; Figarella-Branger, D. ; Reifenberger, G. ; Fleischhack, G. ; Rutkowski, S. ; Donson, A. M. ; Ramaswamy, V. ; Capper, D. ; Ellison, D. W. ; Herold-Mende, C. C. ; Schuller, U. ; Brandner, S. ; Hernaiz Driever, P. ; Kros, J. M. ; Snuderl, M. ; Milde, T. ; Grundy, R. G. ; Hoshino, M. ; Mack, S. C. ; Gilbertson, R. J. ; Jones, D. T. W. ; Kool, M. ; von Deimling, A. ; Pfister, S. M. ; Sahm, F. (Last author) ; Kawauchi, D. (Last author) ; Pajtler, K. (Last author)
Cross-species genomics reveals oncogenic dependencies in ZFTA/C11orf95 fusion-positive supratentorial ependymomas.
Cancer discovery 11(9), 2230-2247 (2021) [10.1158/2159-8290.CD-20-0963]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Kummar, S. ; Berlin, J. ; Mascarenhas, L. ; van Tilburg, C. M. ; Geoerger, B. ; Lassen, U. N. ; Schilder, R. J. ; Turpin, B. ; Nanda, S. ; Keating, K. ; Childs, B. H. ; Chirila, C. ; Laetsch, T. W. ; Hyman, D. M. ; Drilon, A. ; Hong, D. S.
Quality of Life in Adult and Pediatric Patients with Tropomyosin Receptor Kinase Fusion Cancer Receiving Larotrectinib.
Current problems in cancer 45(6), 100734 (2021) [10.1016/j.currproblcancer.2021.100734]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Nesper-Brock, M. (First author) ; Metzler, M. ; Wotschofsky, Z. ; Reinhardt, D. ; Fischer, M. ; Rutkowski, S. ; Kratz, C. ; Thorwarth, A. ; Graf Einsiedel, H. ; Schrappe, M. ; Mauz-Körholz, C. ; Witt, O. (Last author)
Molecular tumor therapy: phase I/II network structure of the Society for Pediatric Oncology and Hematology in Germany[Molekulare Tumortherapie: Phase-I/II-Netzwerkstruktur der Gesellschaft für Pädiatrische Onkologie und Hämatologie]
Der Onkologe 27, 447?457 (2021) [10.1007/s00761-021-00928-5]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Pfaff, E. (First author) ; Adam de Beaumais, T. ; Marchais, A. ; van Tilburg, C. M. ; Blattner-Johnson, M. ; Dirksen, U. ; Øra, I. ; Geoerger, B. ; Schleiermacher, G. ; Pfister, S. ; Witt, O. ; Jones, D. T. W. ; Vassal, G.
NTRK Alterations in Pediatric High-Risk Malignancies Identified Through European Clinical Sequencing Programs Constitute Promising Drug Targets
JCO precision oncology 5, 450 - 454 (2021) [10.1200/PO.20.00417]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Stockklausner, C. (First author) ; Duffert, C. M. ; Cario, H. ; Knöfler, R. ; Streif, W. ; Kulozik, A. E. ; Hämostaseforschung, T. S. d. G. f. T. u. (GTH) ; Hämatologie, o. G. f. P. O. u.
Thrombocytosis in children and adolescents-classification, diagnostic approach, and clinical management.
Annals of hematology 100(7), 1647-1665 (2021) [10.1007/s00277-021-04485-0]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Hartlieb, S. (First author) ; Sieverling, L. (First author) ; Nadler-Holly, M. ; Ziehm, M. ; Toprak, U. H. ; Herrmann, C. ; Ishaque, N. ; Okonechnikov, K. ; Gartlgruber, M. ; Park, Y.-G. ; Wecht, E. M. ; Savelyeva, L. ; Henrich, K.-O. ; Rosswog, C. ; Fischer, M. ; Hero, B. ; Jones, D. T. W. ; Pfaff, E. ; Witt, O. ; Pfister, S. M. ; Volckmann, R. ; Koster, J. ; Kiesel, K. ; Rippe, K. ; Taschner-Mandl, S. ; Ambros, P. ; Brors, B. ; Selbach, M. ; Feuerbach, L. ; Westermann, F. (Last author)
Alternative lengthening of telomeres in childhood neuroblastoma from genome to proteome.
Nature Communications 12(1), 1269 (2021) [10.1038/s41467-021-21247-8]2021 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Rutkowski, S. ; Mynarek, M. ; Milde, T. ; Dietzsch, S. ; Kortmann, R. D.
Current treatment options in central nervous system tumors.[Aktuelle therapeutische Ansätze bei ZNS-Tumoren].
Der Onkologe 27, 478?484 (2021) [10.1007/s00761-021-00902-1]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Kratz, C. P. ; Jongmans, M. C. ; Cavé, H. ; Wimmer, K. ; Behjati, S. ; Guerrini-Rousseau, L. ; Milde, T. ; Pajtler, K. W. ; Golmard, L. ; Gauthier-Villars, M. ; Jewell, R. ; Duncan, C. ; Maher, E. R. ; Brugieres, L. ; Pritchard-Jones, K. ; Bourdeaut, F.
Predisposition to cancer in children and adolescents.
The lancet child & adolescent health 5(2), 142 - 154 (2021) [10.1016/S2352-4642(20)30275-3]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Koelsche, C. (First author) ; Schrimpf, D. (First author) ; Stichel, D. (First author) ; et al
Sarcoma classification by DNA methylation profiling.
Nature Communications 12(1), 498 (2021) [10.1038/s41467-020-20603-4]2021 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Adolph, J. E. ; Fleischhack, G. ; Mikasch, R. ; Zeller, J. ; Warmuth-Metz, M. ; Bison, B. ; Mynarek, M. ; Rutkowski, S. ; Schüller, U. ; von Hoff, K. ; Obrecht, D. ; Pietsch, T. ; Pfister, S. M. ; Pajtler, K. W. ; Witt, O. ; Witt, H. ; Kortmann, R.-D. ; Timmermann, B. ; Krauß, J. ; Frühwald, M. C. ; Faldum, A. ; Kwiecien, R. ; Bode, U. ; Tippelt, S. ; HIT-Network, G. G. (Collaboration Author)
Local and Systemic Therapy of Recurrent Ependymoma in Children and Adolescents: Short- and Long-term Results of the E-HIT-REZ 2005 Study.
Neuro-Oncology 23(6), 1012-1023 (2021) [10.1093/neuonc/noaa276]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Stichel, D. (First author) ; Schrimpf, D. ; Sievers, P. ; Reinhardt, A. ; Suwala, A. K. ; Sill, M. ; Reuss, D. E. ; Korshunov, A. ; Casalini, B. M. ; Sommerkamp, A. C. ; Ecker, J. ; Selt, F. ; Sturm, D. ; Gnekow, A. ; Koch, A. ; Simon, M. ; Hernáiz Driever, P. ; Schüller, U. ; Capper, D. ; van Tilburg, C. M. ; Witt, O. ; Milde, T. ; Pfister, S. M. ; Jones, D. T. W. ; von Deimling, A. ; Sahm, F. ; Wefers, A. (Last author)
Accurate calling of KIAA1549-BRAF fusions from DNA of human brain tumours using methylation array-based copy number and gene panel sequencing data.
Neuropathology & applied neurobiology 47(3), 406-414 (2021) [10.1111/nan.12683]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Ameline, B. ; Kovac, M. ; Nathrath, M. ; Barenboim, M. ; Witt, O. ; Krieg, A. H. ; Baumhoer, D.
Overactivation of the IGF signalling pathway in osteosarcoma: a potential therapeutic target?
The journal of pathology: clinical research 7(2), 165-172 (2021) [10.1002/cjp2.191]2021 DBCoverage BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Stenzinger, A. ; van Tilburg, C. M. ; Tabatabai, G. ; Länger, F. ; Graf, N. ; Griesinger, F. ; Heukamp, L. C. ; Hummel, M. ; Klingebiel, T. ; Hettmer, S. ; Vokuhl, C. ; Merkelbach-Bruse, S. ; Overkamp, F. ; Reichardt, P. ; Scheer, M. ; Weichert, W. ; Westphalen, C. B. ; Bokemeyer, C. ; Ivanyi, P. ; Loges, S. ; Schirmacher, P. ; Wörmann, B. ; Bielack, S. ; Seufferlein, T. T. W.
Diagnosis and therapy of tumors with NTRK gene fusion.[Diagnostik und Therapie von Tumoren mit NTRK-Genfusionen].
Der Pathologe 42(1), 103-115 (2021) [10.1007/s00292-020-00864-y]2021 Fulltext BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

Ecker, J. (First author) ; Thatikonda, V. ; Sigismondo, G. ; Selt, F. ; Valinciute, G. ; Oehme, I. ; Müller, C. ; Buhl, J. L. ; Ridinger, J. ; Usta, D. ; Qin, N. ; van Tilburg, C. M. ; Herold-Mende, C. ; Remke, M. ; Sahm, F. ; Westermann, F. ; Kool, M. ; Wechsler-Reya, R. J. ; Chavez, L. ; Krijgsveld, J. ; Jäger, N. ; Pfister, S. M. ; Witt, O. ; Milde, T. (Last author)
Reduced chromatin binding of MYC is a key effect of HDAC inhibition in MYC amplified medulloblastoma.
Neuro-Oncology 23(2), 226-239 (2021) [10.1093/neuonc/noaa191]2021 BibTeX | EndNote: XML, Text | RIS

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