Translational Genomics

Unsere Forschung

Unsere Arbeitsgruppe "Klinische Bioinformatik - Translationale Genomik", die ebenfalls am KiTZ angesiedelt ist, beschäftigt sich mit der Identifizierung und Klassifizierung von genetischen und epigenetischen Veränderungen in kindlichen Tumoren mit Hilfe computergestützter Methoden. Diese Arbeit ermöglicht es uns, personalisierte molekulare Tumorprofile zu erstellen, die es den Ärzten erlauben, einen maßgeschneiderten Therapieansatz für jeden einzelnen Patienten zu entwickeln. Darüber hinaus konzentrieren wir uns auf die Entwicklung bioinformatischer Methoden zur optimierten Diagnose und Prognose pädiatrischer Krebserkrankungen auf der Grundlage molekularer Daten aus der Hochdurchsatz-Sequenzierung sowie auf die Analyse möglicher Mechanismen der Tumorentstehung.

Unser Team

Dr. Robert Autry

Gruppenleiter
Rolf Kabbe

IT-Coordinator & Cluster Admin
Dr. Christopher Previti

Wissenschaftler

Profil anzeigen
Dr. Jan Müller

Data Scientist
Luisa Becker

PhD Student
Olga Ermakova

PhD Student
Devishi Kesar

PhD Student
Martha O'Brien

Doktorandin
Xiao Wang

MD Student

Ausgewählte Publikationen

2025 - Journal of Clinical Oncology

Investigation of DNA Damage Response Genes Validates the Role of DNA Repair in Pediatric Cancer Risk and Identifies SMARCAL1 as a Novel Osteosarcoma Predisposition Gene

Oak N, Chen W, Blake A, Harrison L, O'Brien M, Previti C, Balasubramanian G, Maass K, Hirsch S, Penkert J, Jones BC, Schramm K, Nathrath M, Pajtler KW, Jones DTW, Witt O, Dirksen U, Li J, Sapkota Y, Ness KK, Guenther LM, Pfister SM, Kratz C, Wang Z, Armstrong GT, Hudson MM, Wu G, Autry RJ, Nichols KE, Sharma R.

2025 - Nature Communications

Somatic gene delivery faithfully recapitulates a molecular spectrum of high-risk sarcomas

Imle R, Blösel D, Kommoss FKF, Placke S, Stutheit-Zhao E, Blume C, Lupar D, Schmitt L, Winter C, Wagner L, von Eicke M, Walzer H, Förderer J, Laier S, Hertwig M, Peterziel H, Oehme I, Scheuerman S, Seitz CM, Geyer FH, Cidre-Aranaz F, Grünewald TGP, Vokuhl C, Chudasama P, Scholl C, Schmidt C, Günther P, Sill M, Jones KB, Pfister SM, Autry RJ, Banito A

2023 - Nat Cancer

Comprehensive analysis of mutational signatures reveals distinct patterns and molecular processes across 27 pediatric cancers

Thatikonda V, Islam SMA, Autry RJ, Jones BC, Gröbner SN, Warsow G, Hutter B, Huebschmann D, Fröhling S, Kool M, Blattner-Johnson M, Jones DTW, Alexandrov LB, Pfister SM, Jäger N.

2022 - J Natl Cancer Inst

Heterozygous BRCA1 and BRCA2 and Mismatch Repair Gene Pathogenic Variants in Children and Adolescents With Cancer

Kratz CP, Smirnov D, Autry R, Jäger N, Waszak SM, Großhennig A, Berutti R, Wendorff M, Hainaut P, Pfister SM, Prokisch H, Ripperger T, Malkin D.