Abteilung RNA-Biologie und Krebs

Prof. Dr. Sven Diederichs

Die Argonauten - Per aspera ad astra
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Neue Einblicke in die RNA-Biologie haben einen Paradigmenwechsel eingeleitet, in dem RNAs als funktionell bedeutsame Moleküle wahrgenommen werden. Ein Großteil des menschlichen Genoms (mindestens 70 Prozent) wird in RNA umgeschrieben, aber nur etwa zwei Prozent des Genoms kodieren für Proteine. Nicht-protein-kodierende RNAs können wichtige Funktionen in der Zelle ausführen: Die sehr kurzen microRNAs sind wichtige Regulatoren der Genexpression mit tumor-suppressiver oder onkogener Funktion. Neu entdeckte lange nicht-kodierende RNAs (ncRNA, lncRNA oder lincRNA) erfüllen wichtige Aufgaben in der epigenetischen Regulation, beim Umbau des Chromatins oder dem Spleißen. Insgesamt gibt es in der menschlichen Zelle viel mehr RNA-Moleküle als erwartet und viele davon warten vielleicht nur auf ihre Entdeckung als bedeutsame Faktoren in Tumoren.

Unsere Forschung konzentriert sich auf lange nicht-protein-codierende RNAs (lncRNAs) und ihre Rolle bei der Entstehung und Progression von Krebserkrankungen. Nachdem wir die Expression Tausender ncRNAs in drei Tumorentitäten - Lungenkrebs, Leberkrebs und Brustkrebs - bestimmt haben, klären wir nun die zellulären und molekularen Funktionen der differentiell exprimierten ncRNAs in Tumoren mit innovativen Methoden wie CRISPR/Cas9, RNA-Affinitätsaufreinigung und einer eigens von uns entwickelte siRNA-Bibliothek gegen tumor-assoziierte lncRNAs auf. Da viele RNA-Moleküle im Komplex mit Proteinen aktiv sind, haben wir proteom-weit RNA-abhängige Protein-Komplexe identifiziert und untersuchen deren physiologische und pathologische Funktionen.

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Kontakt

Prof. Dr. Sven Diederichs
RNA-Biologie und Krebs (B150)
Deutsches Krebsforschungszentrum
Im Neuenheimer Feld 280
69120 Heidelberg
Tel: +49 6221 42 4380

Ausgewählte Publikationen

  • Dhamija S.*, et al. (2020). A Pan-Cancer Analysis reveals Nonstop Extension Mutations causing SMAD4 Tumor Suppressor Degradation. Nature Cell Biology epub
  • Gandhi M., et al. (2020). The lncRNA lincNMR regulates nucleotide metabolism via a YBX1 - RRM2 axis in cancer. Nature Communications 11: 3214
  • Sharma Y.*, et al. (2019). A pan-cancer analysis of synonymous mutations. Nature Communications 10: 2569
  • Caudron-Herger M., et al. (2019). R-DeeP: Proteome-wide and Quantitative Identification of RNA-dependent Proteins by Density Gradient Ultracentrifugation. Molecular Cell 75: 184-199
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