Medizinische Informatik in der Translationalen Onkologie

Abteilung Medizinische Informatik in der Translationalen Onkologie

Prof. Dr. Frank Ückert

Föderation verteilten Wissens zur gemeinsamen Nutzung in der Forschung (stark vereinfacht)
© dkfz.de

Unser Team arbeitet daran, hochkomplexe Daten in Wissen zu verwandeln, das bei der Bekämpfung von Krebs eingesetzt werden kann. Dazu arbeiten wir mit anderen Experten interdisziplinär zusammen und greifen auf deren Erfahrungen zurück.

Die Mitarbeiter der Abteilung „Medizinische Informatik in der Translationalen Onkologie“ (E240), oder kurz MITRO, entwickeln innovative Prozesse sowie maßgeschneiderte Methoden und Werkzeuge für Ärzte und Forscher, um heterogene Datenbestände für die Krebsforschung nutzbar zu machen, interdisziplinäre und internationale Kooperationen zu ermöglichen und komplexe Analysen zu vereinfachen.

Zu diesem Zweck arbeiten wir daran, Daten aus verschiedenen Quellen für denselben Patienten und/oder Probanden in ein IT-System zu integrieren, das wir als „Electronic Science Record“ (ESR) bezeichnen. Ein Bestandteil des ESR, der auch diverse Analysewerkzeuge wie MRI auf HANA von SAP, cBioPortal und tranSMART benutzt, ist unser Data Warehouse. Die hier gesammelten Daten, beispielsweise MR-Serien, vollständige Genomsequenzen und Phänotypbeschreibungen, kombinieren wir automatisch mit Informationen aus Veröffentlichungen und verschiedenen Datenbanken. Daraus wollen wir – über die Kenntnis von Modellen, aber auch über Algorithmen des maschinellen Lernens - klinische Entscheidungshilfen liefern und Forschungshypothesen entwerfen, aber auch zu einem tieferen Verständnis der Erkrankung beitragen.

Der Mehrwert, Dateninhaber und Methodiker zusammenzubringen, kommt molekularbiologisch tätigen Ärzten und Datenforschern zugute.

Kontakt

Prof. Dr. Frank Ückert
Medizinische Informatik in der Translationalen Onkologie (E240)
Deutsches Krebsforschungszentrum
Im Neuenheimer Feld 280
69120 Heidelberg
Tel: +49 6221 42-5101

Ausgewählte Publikationen

  • Lablans, M., Kadioglu, D., Mate, S., Leb, I. Prokosch, H.-U. & Ueckert, F. (2016). Strategien zur Vernetzung von Biobanken. Bundesgesundheitsblatt 59:373-378
  • Ückert F., Ammenwerth E., Dujat C., Grant A., Haux R., Hein A., Hochlehnert A., Knaup-Gregori P., Kulikowski C., Mantas J., Maojo V., Marschollek M., Moura L., Plischke M., Röhrig R., Stausberg J., Takabayashi K., Winter A., Wolf K.H., Hasman A. (2014). Past and next 10 years of medical informatics. J Med Syst. 38(7), 74
  • Lablans, M., Kadioglu, D., Muscholl, M. & Ueckert, F. (2015). Exploiting Distributed, Heterogeneous and Sensitive Data Stocks while Maintaining the Owner’s Data Sovereignty. Methods Inf Med 2015; 54(4), 346-352
  • Lablans, M., Borg, A. & Ueckert, F. (2015). A RESTful interface to pseudonymization services in modern web applications. BMC Med Inform Decis Mak., 15:2
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