Inhaltsübersicht

Einleitung

Die in unserer Abteilung durchgeführten Hochdurchsatz-Studien zur Analyse genomischer Aberrationen und Expressions-Veränderungen spezifischer Gene wären ohne computergestützte Datenverarbeitung nicht möglich. Unser Team entwickelt in diesem Zusammenhang eine Datenverarbeitungs-Plattform. Mit ihr soll die Möglichkeit geschaffen werden, unterschiedlichsten und interessantesten Fragestellungen nachzugehen. Sie umfaßt Bereiche von der Chip-Herstellung bis hin zur statistischen Evaluation resultierender experimenteller Daten.

Technologien

Im Wesentlichen beinhaltet die Plattform verschiedene MySQL Datenbanken, auf die über durch DOM Implementierung erweiterte php bzw. perl web Interface zugegriffen werden kann

Computing Scope

Im Wesentlichen beinhaltet die Plattform verschiedene MySQL Datenbanken, auf die über durch DOM Implementierung erweiterte php bzw. perl web Interface zugegriffen werden kann.

Statistische Methoden

Zur statistischen Analyse verwenden wir hauptsächlich die R Programmierumgebung sowie verschiedene Bioconductor packages. Wir haben Hochleistungsrechenzentren an unsere Platform angebunden, welche die statistischen Analysen durch.