Microarray-Analysen sind ein wichtiges Hilfsmittel für die Charakterisierung von DNA-Methylierungsmustern. Wir haben Microarrays verwendet, um DNA-Methylierungsveränderungen in Krebspatienten während der Azazytidin-Therapie nachzuweisen und um alternsabhängige DNA-Methylierungs-Biomarker zu identifizieren. | © dkfz.de

Abweichende DNA-Methylierungsmuster stellen eines der frühesten und konsistentesten Merkmale von Krebszellen dar. Insofern erlaubt der Nachweis und die Klassifizierung tumorspezifischer DNA-Methylierungsmuster neue Möglichkeiten in der Krebsdiagnostik. Wir haben mehrere biochemische und molekularbiologische Verfahren zur Identifizierung und Charakterisierung von Cytosin-Methylierungsmustern etabliert. Bekannte Besipiele sind die Verwendung der Kapillarelektrophorese zur Quantifizierung des genomischen Cytosin-Methylierungsniveaus und die Bisulfitsequenzierung für die Analyse von RNA-Methylierungsmustern. Diese Methoden werden nun in einer Vielzahl von Projekten zur Charakterisierung von Methylierungsveränderungen in microRNA-Genen und während der Zelldifferenzierung und –alterung angewendet. Darüberhinaus setzen wir unsere Methoden auch ein, um durch demethylierende Chemotherapeutika induzierte epigenetischen Veränderungen in Krebspatienten nachzuweisen.